Nossa plataforma científica,Tela ChomiX, que é baseado no DIA-ABPP (Data Independent Acquisition-Activity Based Protein Profiling), é uma parte importante de nossa metodologia líder em ABPP. Através do nossoTela ChomiXplataforma de tecnologia, podemos rastrear compostos de chumbo covalentes para alvos não-drogáveis. O processo específico inclui tratamento com moléculas covalentes de células vivas, separação e enriquecimento de peptídeos marcados com sondas químicas, detecção por espectrometria de massa de alta resolução e construção de uma rede de ligação ao local-alvo do medicamento. Isso nos permite avaliar a capacidade de ligação e a seletividade de medicamentos para bolsas específicas de resíduos de aminoácidos em múltiplos alvos proteicos simultaneamente, gerando compostos candidatos. Atualmente, construímos uma biblioteca abrangente de alvos proteicos, incluindo a maior biblioteca doméstica de compostos covalentes direcionados à cisteína. , com base em nossa biblioteca de sondas químicas e outros módulos principais característicos.
A taxa de ocupação do sítio de ligação (sítio Protein_Cys) para cada composto é determinada usando as intensidades de espectrometria de massa de peptídeos quantificados marcados com sonda. Em essência, a sonda específica da cisteína compete com os compostos pela ligação a uma determinada bolsa de ligação. Quanto mais baixo for o sinal do péptido marcado com sonda, mais forte será a capacidade de ocupação do composto. Para cada local de cisteína da proteína de interesse (POI), a determinação das razões de envolvimento do alvo dependentes da dose (TE50) é conduzida para compostos selecionados. Os candidatos atingidos são então confirmados através da classificação dos seus valores TE50. Quanto menor o TE50, mais forte o composto ocupa o sítio de cisteína do POI nas células vivas.
