Produtos
Identificação e Análise de Seletividade de Alvos Degradadores de Proteínas
Nos últimos anos, a degradação proteica direcionada (TPD) emergiu como uma estratégia terapêutica inovadora com o objetivo de modular a doença intervindo na expressão proteica utilizando moléculas de fármacos. Entre essas abordagens, as quimeras direcionadas à proteólise (PROTACs) têm recebido atenção significativa. O conceito de PROTAC foi proposto pela primeira vez por Crews et al. em 2001, com a ideia central de aproveitar o sistema endógeno ubiquitina-proteassoma para degradar proteínas alvo, atingindo assim objetivos terapêuticos. Devido à sua alta atividade, capacidade de atingir proteínas "invencíveis" e superar a resistência aos medicamentos, os PROTACs tornaram-se um tema quente no desenvolvimento de medicamentos, com grandes empresas farmacêuticas como Pfizer, Bayer e Merck ativamente envolvidas em pesquisa e desenvolvimento nesta área. .
Além dos PROTACs, existem várias estratégias semelhantes, incluindo degradadores de cola molecular utilizando o sistema ubiquitina-proteassoma, quimeras de direcionamento de lisossomos (LYTACs) utilizando a via endossomo-lisossomo, bem como quimeras de direcionamento de autofagia (AUTACs) e compostos de amarração de autofagossoma (ATTECs). ) utilizando a via autofagia-lisossomo. Essas abordagens estão abrindo caminho para novos caminhos no tratamento de doenças.
No entanto, um critério chave de avaliação no desenvolvimento de tais moléculas é se elas podem degradar proteínas alvo especificamente sem afetar a abundância de outras proteínas na célula. Para atingir esse objetivo, a tecnologia proteômica quantitativa desempenha um papel crucial. Esta tecnologia permite a comparação quantitativa da abundância da mesma proteína em diferentes amostras ao nível do proteoma utilizando espectrometria de massa de alta resolução. Atualmente, uma estratégia proteômica quantitativa comumente usada envolve a introdução de rótulos de isótopos estáveis durante a preparação da amostra de peptídeos. Durante a detecção por espectrometria de massa, peptídeos com a mesma sequência de aminoácidos, mas de amostras diferentes, exibem diferentes proporções de massa para carga devido à diferença na massa do marcador isotópico. Portanto, a proporção de íons co-eluídos da mesma sequência peptídica pode refletir quantitativamente a abundância da mesma proteína em diferentes amostras. Esta estratégia não só melhora a eficiência da preparação de amostras e aquisição de dados de espectrometria de massa, mas também reduz erros experimentais entre amostras, tornando os resultados mais estáveis e confiáveis.
Plataforma Técnica
A Chomix desenvolveu uma variedade de plataformas de tecnologia de proteômica química quantitativa. Suas plataformas inovadoras permitem análises qualitativas e quantitativas precisas de mais de 5.000 proteínas em uma única linha celular, fornecendo suporte robusto para análises abrangentes de seletividade de alvos. Tomando o exemplo da plataforma de tecnologia proteômica multiquantitativa baseada na rotulagem Tandem Mass Tag (TMT), esta tecnologia primeiro extrai todo o proteoma de amostras de células tratadas com degradadores de proteínas e depois as processa por meio de digestão enzimática e etapas de rotulagem multiquantitativa antes sendo misturados. Para aumentar a profundidade de cobertura do proteoma, a cromatografia líquida é normalmente utilizada para pré-fracionamento de amostras de peptídeos, seguida pela detecção por espectrometria de massa de cada amostra de peptídeo, analisando profundamente as diferenças de abundância de proteínas entre amostras e elucidando informações cruciais do alvo e dados de seletividade. Esta plataforma fornece avaliação e orientação para o desenvolvimento e otimização de degradadores de proteínas.
Nossas vantagens
1. Excelência Técnica: Equipe experiente, publicações em periódicos de primeira linha e serviços confiáveis do setor.
2. Tecnologia Central de Patentes: Patentes exclusivas e hardware avançado para suporte ao desenvolvimento inicial de medicamentos.
3. Serviço completo: Abrangendo design de sonda, síntese, descoberta de alvos, análise de bioinformática e feedback de progresso oportuno para satisfação do cliente.
4. Gestão rigorosa da qualidade: A certificação ISO9001 garante relatórios confiáveis e autênticos.
Nosso serviço
| Projeto | Identificação e Análise de Seletividade de Alvos Degradadores de Proteínas |
| Amostra | Lisado celular, células vivas |
| Plataforma de Hardware | Pulverizador de células ultrassônicas sem contato, sistema de imagem ChemiDoc MP, espectrômetro de massa Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Duração do Projeto | 3-4 semanas |
| Entregáveis | Relatório do Projeto (incluindo procedimentos experimentais, gráficos de análise de dados, resultados de análises de bioinformática) |
| Preço | Clique para consultar |
Estudo de caso
Objetivo do projeto: Duas moléculas PROTAC foram projetadas e sintetizadas. As proteínas dentro e fora do alvo precisam ser analisadas para comparação de seletividade.
Método experimental: O método MS quantitativo baseado em TMT foi utilizado para análise proteômica.
Resultados do projeto:
Um total de 5.900 proteínas foram quantificadas em linhagens de células tumorais e alvos ON e OFF foram identificados para moléculas PROTAC1 e 2 (espectrômetro de massa Orbitrap Exploris 480, TMT10plex e análise de dados por PD 2.5)
