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Identificação de alvos de fármacos de pequenas moléculas não covalentes com base em sondas de fotoafinidade
Plataforma Técnica
A plataforma de identificação de alvos proteômicos químicos baseada em sondas de fotoafinidade envolve várias etapas importantes, incluindo design de sonda, síntese, avaliação de atividade, rotulagem, enriquecimento de proteínas e análise de dados. Drogas não covalentes de pequenas moléculas, como compostos sintéticos, extratos de ervas, produtos naturais e metabólitos, podem ser modificadas em sondas de fotoafinidade. Uma vez que estas sondas se ligam aos seus alvos dentro das células, elas formam interações covalentes estáveis, permitindo o enriquecimento seletivo e a identificação de proteínas alvo de baixa abundância.
Nossas vantagens
1. Excelência Técnica: Equipe experiente, publicações em periódicos de primeira linha e serviços confiáveis do setor.
2. Tecnologia Central de Patentes: Patentes exclusivas e hardware avançado para suporte ao desenvolvimento inicial de medicamentos.
3. Serviço completo: Abrangendo design de sonda, síntese, descoberta de alvos, análise de bioinformática e feedback de progresso oportuno para satisfação do cliente.
4. Gestão rigorosa da qualidade: A certificação ISO9001 garante relatórios confiáveis e autênticos.
Nosso serviço
| Projeto | Identificação de alvos diretos para medicamentos não covalentes de moléculas pequenas |
| Amostra | Proteína recombinante, lisado celular, células vivas, tecido doente, sangue, bactérias, tecido vegetal |
| Plataforma de Hardware | Pulverizador de células ultrassônicas sem contato, sistema de imagem ChemiDoc MP, espectrômetro de massa Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Duração do Projeto | 4-8 semanas |
| Entregáveis | Relatório do Projeto (incluindo procedimentos experimentais, gráficos de análise de dados, resultados de análises de bioinformática) |
Estudo de caso
Durante o processo de triagem de medicamentos, utilizando tecnologia de triagem de viabilidade celular, descobriu-se que o composto A exibia efeitos inibitórios significativos nas células alvo. Para identificar melhor suas proteínas-alvo em nível molecular, decifrar seu mecanismo de ação e explorar novos alvos potenciais, nossa empresa projetou e sintetizou a sonda fotorreativa Sonda A (incorporando grupos fotorreativos e bioortogonais) com base na estrutura e características de atividade do composto A. Aproveitando a plataforma de tecnologia proteômica química, empregamos técnicas de marcação por fluorescência e espectrometria de massa para identificação de proteínas alvo em linhagens celulares relevantes para a atividade. Combinado com métodos de análise bioinformática, nos aprofundamos no mecanismo de ação do composto A e suas novas proteínas alvo associadas.
Com base na análise do gel de fluorescência do experimento de marcação, a Sonda A marca efetivamente as proteínas, e o sinal de marcação pode ser significativamente competido pelo composto A. Isso indica que a Sonda A tem uma cobertura de alvo semelhante ao composto A, tornando-a uma ferramenta de sonda química adequada para descoberta subsequente do alvo.
O gráfico do Vulcão ilustra os resultados do experimento Sonda A vs DMSO (Direto), onde 114 proteínas (destacadas em vermelho no gráfico superior) foram significativamente enriquecidas pela Sonda A. Na Sonda A vs (A+Sonda A) (Competição) experimento, 38 proteínas (destacadas em vermelho no gráfico inferior) foram marcadas pela Sonda A e competiram significativamente pelo composto A original. Esses dois experimentos geraram 32 proteínas com ligação de alta confiança ao composto A (n = 3, razão ≥ 2, valor p ≤ 0,05). A análise da via biológica GO das 32 proteínas com ligação de alta confiança ao composto A revelou enriquecimento significativo nas vias de sinalização, como efluxo de fosfolipídios, regulação negativa da atividade da lipase e regulação do transporte de esterol, alinhando-se com o fenótipo.
