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Plataforma de descoberta de alvos: desvendando os mecanismos dos produtos naturais
O umingrediente ativodentro deA medicina chinesa é umuma série decompostoéisso haeuatividade terapêutica ou fisiológicaies.Os medicamentos chineses são ricos em variedade, complexos em composição e possuem uma ampla gama de ingredientes ativos,constituindoum importantecaminho para adquiriringredientes ativos, compostos de chumbo e makingmedicação.
Nossoplataforma quimioproteômicase destaca emdescobriringalvos proteicospara nprodutos naturais na medicina chinesa.É engenhosamentetransformarsão estesprodutos naturais em sondas químicas multifuncionais, espelhando sua biografiaAtividades.Estas sondas, quando aplicadas em células vivas ou tecidos doentes, podemcapturar diretamenteproteínas de ligação a produtos naturais.Com a ajuda de reações de acoplamento bioortogonais, isolamos e enriquecemos com precisão essas proteínas alvo. Utilizandoespectro de massa de alta resoluçãoometria, alcançamos precisão exata até os bolsos de encadernação.Ele nos equipainformações mais completas e precisas, pronto para revelarointrincadomecanismosubjacente aoingredientes ativos na medicina chinesa.
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Identificação de bolsas de ligação de pequenas moléculas não covalentes em células
Identificação de bolsas não covalentes de ligação de moléculas pequenas em células Características técnicas da plataforma É fundamental determinar o modo de ligação entre medicamentos de moléculas pequenas e seus alvos proteicos para pesquisa e desenvolvimento de medicamentos.Uma análise abrangente dessas interações nos níveis estrutural e físico-químico poderia aprofundar significativamente nossa compreensão das funções das proteínas e facilitar o projeto e a otimização de medicamentos.Técnicas de biologia estrutural, incluindo raios X, medição crioeletrônica... -
Perfil de todo o proteoma para medicamentos de degradação de proteínas direcionadas (TPD)
O medicamento Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) é uma molécula bifuncional que pode se ligar à proteína alvo e recrutar a ubiquitina E3 ligase para degradação.Portanto, novas modalidades como PROTAC e cola molecular têm a capacidade de alterar inadvertidamente a abundância de proteínas endógenas, o que fornece um novo método terapêutico para alvos proteicos, especialmente as proteínas não-drogáveis.Quantificar de forma abrangente a abundância de proteínas dentro e fora do alvo tem sido um dos experimentos padrão para pesquisa e desenvolvimento de medicamentos TPD.
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Identificação de alvos proteicos por proteômica diferencial
Identificação de alvos proteicos por plataforma de proteômica diferencial Características técnicas A proteômica diferencial estuda as alterações do proteoma sob diferentes estados fisiológicos ou patológicos, como tratamentos medicamentosos ou regulação genética, comparando duas ou mais amostras.Esta abordagem lança luz sobre processos vitais importantes ou doenças importantes, a fim de descobrir as principais proteínas diferentes que são consideradas marcadores para análise qualitativa e funcional.Milhares de proteínas... -
Perfil quimioproteômico de alvos proteicos para medicamentos não covalentes de moléculas pequenas
Interações não covalentes, como ligações de hidrogênio e empilhamento π-π, podem ser interrompidas devido à desnaturação da proteína.Para enfrentar esse desafio, a plataforma ChomiX emprega marcação por fotoafinidade, uma técnica bem estabelecida para anexar com precisão “rótulos químicos” ao sítio ativo de uma proteína.Além disso, a inovadora estratégia de reticulação química in situ da ChomiX transforma interações transitórias de proteínas não covalentes em ligações químicas covalentes e permanentes.Ao utilizar uma sonda química que é funcionalizada com frações de fotoafinidade e bioortogonais, a plataforma quimioproteômica da ChomiX demonstrou sua eficácia na pesca com sucesso de alvos proteicos em lisados celulares, tecidos e células vivas.O espectro de medicamentos bioativos de pequenas moléculas aplicados na plataforma abrange uma variedade de compostos, incluindo metabólitos endógenos, produtos naturais e moléculas sintéticas não covalentes.
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Perfil quimioproteômico competitivo de alvos proteicos para medicamentos covalentes de pequenas moléculas
Semelhante aos medicamentos não covalentes, a estratégia de pulldown direto usando sondas químicas funcionalizadas com grupos repórteres também foi demonstrada com sucesso para medicamentos covalentes de pequenas moléculas.Contudo, vale ressaltar que alguns fármacos covalentes são intolerantes a modificações químicas devido à perda de bioatividade ou inacessibilidade sintética.Além disso, a ligação covalente formada é geralmente instável durante a detecção de MS.
A estratégia quimioproteômica competitiva é uma alternativa ideal, que utiliza uma sonda universal baseada em atividade para rotulagem de proteínas.Sondas químicas específicas foram desenvolvidas para reagir com resíduos de cisteína, lisina, serina e histidina.Em princípio, uma vez ocupado por uma pequena molécula covalente, o resíduo de aminoácido não pode ser marcado pela sonda.Como resultado, os alvos ON e OFF poderiam ser identificados de forma abrangente por esta estratégia competitiva com a resolução de aminoácidos.
