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Análise de modificações pós-traducionais de proteínas (PTMs) com base em sondas químicas

 

Além das estratégias tradicionais de enriquecimento de anticorpos, técnicas de marcação química, enzimática e metabólica têm sido progressivamente aplicadas no enriquecimento e identificação de modificações pós-traducionais (PTM) em proteínas. O princípio subjacente envolve o uso de reação química ou catálise enzimática para anexar covalentemente sondas moleculares específicas a modificações alvo ou resíduos modificadores, seguido de análise proteômica. Esta abordagem emergente em quimioproteômica está se tornando importante no estudo de modificações proteicas de baixa abundância, como palmitoilação, miristoilação e glicosilação. Notavelmente, oferece a vantagem de ser aplicável em células vivas, evitando assim possíveis interferências, como a oxidação resultante do estresse celular.


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Serviço Técnico

1. Modificações pós-tradução da cisteína

A cisteína (Cys) é um aminoácido contendo enxofre comum nas proteínas, e seu grupo tiol desempenha papéis cruciais na regulação da homeostase redox molecular, influenciando reações enzimáticas, interações proteína-proteína e estabilidade proteica através de diversos processos de modificação pós-tradução. Modificações pós-traducionais comuns na cisteína incluem palmitoilação, nitrosilação, sulfenilação e sulfonação. A Colosseum Biosciences desenvolveu sondas universais ou estratégias de marcação metabólica visando resíduos de cisteína e estabeleceu plataformas proteômicas químicas correspondentes para identificação de modificações pós-traducionais. Esta plataforma identifica com precisão proteínas alvo e locais de modificação de modificações pós-traducionais.

2. Modificações Pós-Traducionais de Lisina

A lisina (Lys) é um dos aminoácidos com as mais diversas modificações pós-traducionais (PTMs) no proteoma. Modificações pós-traducionais de lisina reversível (Lys-PTMs) são processos bioquímicos comuns que desempenham papéis indispensáveis ​​na regulação de numerosas funções celulares críticas. As modificações pós-tradução na lisina incluem acetilação, succinilação, propionilação, butirilação, crotonilação, malonilação e lactilação. A Colosseum Biosciences desenvolveu uma plataforma de tecnologia de proteômica química baseada em sondas químicas para modificações pós-traducionais de lisina, que identifica com precisão proteínas-alvo e locais de modificação.

3. Modificações pós-traducionais de serina/treonina

Modificações pós-traducionais comuns na serina (Ser) e treonina (Thr) incluem principalmente fosforilação, O-glicosilação, etc. Essas modificações impactam significativamente o estado de atividade das proteínas e suas interações com outras moléculas, desempenhando papéis importantes em vários processos biológicos importantes. Portanto, a análise deste tipo de modificação pós-traducional é um tópico importante na pesquisa da função proteica. A Colosseum Biosciences utiliza materiais de enriquecimento de fosforilação, sondas químicas de glicano não natural e outras ferramentas para identificar com precisão proteínas alvo e locais de modificação para este tipo de modificação pós-tradução.

Nossas vantagens

01. Altamente Profissional:Desenvolvido pelo grupo de pesquisa do Professor Wang Chu da Universidade de Pequim, o cientista-chefe da nossa empresa.

02. Plataforma única:Abrangendo todo o fluxo de trabalho, desde o design da sonda, síntese da sonda, descoberta de alvos até análise de bioinformática.

03. Não há necessidade de anticorpos:Modificação específica da sonda química,Fisiológico

04. Meio Ambiente:Aplicável tanto em lisados ​​como em células vivas.

05. Ampla experiência:Experiência acumulada em mais de 10 tipos diferentes de PTMs

06. Plataforma de alto desempenho:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480,Thermo Fisher Q Exativo HF-X,Tempos brutosTOF

Estudo de caso

Itaconação refere-se ao processo no qual o itaconato se liga covalentemente a locais específicos nas proteínas durante a modificação pós-tradução. Esta modificação pode alterar a estrutura e função da proteína, influenciando o seu papel dentro da célula. Por exemplo, a itaconação pode regular a atividade enzimática, a estabilidade ou as interações com outras moléculas. Como o itaconato é um intermediário no ciclo do ácido tricarboxílico, esta modificação está intimamente ligada ao estado metabólico da célula. A pesquisa mostrou que a itaconação desempenha um papel significativo na patologia de certas doenças, e a compreensão desse mecanismo de modificação poderia auxiliar no desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas.

As células marcadas metabolicamente com sondas ITalk ao nível das células vivas foram lisadas, seguidas de reacção de clique, enriquecimento, digestão enzimática e outras etapas para determinar o local específico da acidificação itacónica.

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