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Perfil quimioproteômico de alvos proteicos para medicamentos não covalentes de pequenas moléculas
Interações não covalentes, como ligações de hidrogênio e empilhamento π-π, podem ser interrompidas devido à desnaturação da proteína. Para enfrentar esse desafio, a plataforma ChomiX emprega marcação por fotoafinidade, uma técnica bem estabelecida para anexar com precisão “rótulos químicos” ao sítio ativo de uma proteína. Além disso, a inovadora estratégia de reticulação química in situ da ChomiX transforma interações proteicas não covalentes transitórias em ligações químicas covalentes e permanentes. Ao utilizar uma sonda química que é funcionalizada com frações de fotoafinidade e bioortogonais, a plataforma quimioproteômica da ChomiX demonstrou sua eficácia na pesca com sucesso de alvos proteicos em lisados celulares, tecidos e células vivas. O espectro de medicamentos bioativos de pequenas moléculas aplicados na plataforma abrange uma variedade de compostos, incluindo metabólitos endógenos, produtos naturais e moléculas sintéticas não covalentes.
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Perfil quimioproteômico competitivo de alvos proteicos para medicamentos covalentes de pequenas moléculas
Semelhante aos medicamentos não covalentes, a estratégia de pulldown direto usando sondas químicas funcionalizadas com grupos repórteres também foi demonstrada com sucesso para medicamentos covalentes de pequenas moléculas. Contudo, vale ressaltar que alguns fármacos covalentes são intolerantes a modificações químicas devido à perda de bioatividade ou inacessibilidade sintética. Além disso, a ligação covalente formada é geralmente instável durante a detecção de MS.
A estratégia quimioproteômica competitiva é uma alternativa ideal, que utiliza uma sonda universal baseada em atividade para rotulagem de proteínas. Sondas químicas específicas foram desenvolvidas para reagir com resíduos de cisteína, lisina, serina e histidina. Em princípio, uma vez ocupado por uma pequena molécula covalente, o resíduo de aminoácido não pode ser marcado pela sonda. Como resultado, os alvos ON e OFF poderiam ser identificados de forma abrangente por esta estratégia competitiva com a resolução de aminoácidos.
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Descoberta quimioproteômica de novas estruturas de chumbo para alvos indrogáveis
Descoberta quimioproteômica de novas estruturas de chumbo para alvos não-drogas Antecedentes Técnicos Atualmente, apenas cerca de 800 proteínas foram alvo de medicamentos aprovados pela FDA, e um grande número de alvos relacionados a doenças são “invencíveis”. Porque, actualmente, a maioria das tecnologias depende de proteínas purificadas. O advento da quimioproteômica revolucionou a descoberta de medicamentos, desde proteínas purificadas até células vivas. É capaz de analisar quantitativamente as interações entre pequenas moléculas e...
