Реактивность аминокислотных остатков в белках играет решающую роль в регуляции функции белков и разработке лекарств. Возьмем, к примеру, цистеин, хотя он и составляет всего 1,4% протеома, но его распределение относительно равномерно. Из-за своей высокой химической реакционной способности тиоловой группы он в основном обнаруживается в дисульфидных связях, активных центрах ферментов, местах связывания металлических лигандов и карманах связывания малых молекул с лекарственными средствами. В результате многие ковалентные препараты нацелены на остатки цистеина, например, ковалентные препараты низкомолекулярной киназы (ссылка). В большинстве конъюгатов антитело-лекарственное средство (ADC) также используются остатки цистеина для конъюгирования низкомолекулярных лекарственных средств с поверхностью антитела. Существуют различные посттрансляционные модификации остатков цистеина, такие как S-нитрозилирование, сульфинилирование и тиоэтерификация, которые регулируют структуру и взаимодействия белков. Кроме того, остатки лизина, серина, метионина, тирозина и гистидина в белках также обладают уникальной химической реакционной способностью, что делает их применимыми при разработке ковалентных лекарств и селективном мечении белков.

Репрезентативными продуктами являются следующие: