head_banner1

Продукты

Хемопротеомическое профилирование белковых мишеней нековалентных низкомолекулярных препаратов

Технические характеристики платформы

Маломолекулярные препараты играют важную роль в области исследований и разработок лекарственных средств.Текущие одобренные FDA лекарства нацелены в общей сложности на 812 различных белков человека.Среди препаратов, направленных против вышеперечисленных мишеней, 84% являются низкомолекулярными препаратами.Более того, только 639 из этих белков подверглись воздействию низкомолекулярных лекарств.Взаимодействие между низкомолекулярным лекарственным средством и белком-мишенью включает нековалентный и ковалентный режимы, причем первый в настоящее время является доминирующим.

Нековалентные взаимодействия, такие как водородные связи и π-π-укладка, могут быть нарушены из-за денатурации белка.Чтобы решить эту проблему, наша платформа использует фотоаффинную маркировку — хорошо зарекомендовавший себя метод точного прикрепления «химических меток» к активному сайту белка.Кроме того, наша инновационная стратегия химического сшивания in situ преобразует временные нековалентные взаимодействия белков в ковалентные и постоянные химические связи.Используя химический зонд, который функционализирован как фотоаффинными, так и биоортогональными фрагментами, платформа хемопротеомики ChomiX продемонстрировала свою эффективность в успешном обнаружении белковых мишеней в клеточных лизатах, тканях и живых клетках.Спектр биоактивных низкомолекулярных препаратов, применяемых на платформе, включает множество соединений, включая эндогенные метаболиты, натуральные продукты и нековалентные синтетические молекулы.

фото_20230511105908

Рабочий процесс

非共价流程图英文小

Платформа следует структурированному рабочему процессу, начиная с маркировки живых клеток с помощью фотоаффинного зонда, полученного из нековалентных молекул.Последующие этапы включают извлечение меченых протеомов, биоортогональное лигирование, обогащение на основе стрептавидина, протеазное расщепление, изотопное мечение и, наконец, масс-спектрометрическое обнаружение.

Тематическое исследование

Цель проекта

Соединение А показало хорошую антипролиферационную активность в анализе жизнеспособности клеток.Платформу химиопротеомики использовали для характеристики белков-мишеней.

Экспериментальный метод

Фотоаффинный химический зонд Probe A был разработан и синтезирован на основе данных SAR соединения A. Зонд A также продемонстрировал аналогичную антипролиферационную активность в линии опухолевых клеток.Были проведены эксперименты на основе геля и МС.Данные МС анализировали для выявления МОА.

Визуализация данных

跑胶

Результаты флуоресценции на основе геля показали, что зонд А может эффективно метить белки, и сигнал мечения может в значительной степени конкурировать со стороны соединения А. В совокупности эти данные показали, что зонд А можно использовать в качестве химического зонда для последующего обнаружения мишени, поскольку он может связывать те же белки, что и соединение А.

散点图зондA
44
5

График вулкана показал, что 114 белков (выделено красным) были значительно обогащены зондом A в группе зонда A по сравнению с группой ДМСО (прямой), а 38 белков (выделено красным) значительно конкурировали с соединением A в группе зонда A по сравнению с (A+зондом A). ) (Конкурсная) группа.Диаграммы Венна показали, что 32 перекрывающихся белка могут с высокой степенью уверенности быть потенциальными мишенями для связывания соединений А.n = 3, соотношение ≥2,p-значение ≤ 0,05


  • Предыдущий:
  • Следующий:

  • Напишите свое сообщение здесь и отправьте его нам