Изображение научного сотрудника в лаборатории

Химическая протеомика – SLC15A4

[Прорыв с высокими оценками] Улучшение противовоспалительной регуляции SLC15A4 с помощью нового ингибитора AJ 2-30: подход химической протеомики (IF 14.8)

В этой статье используется химическая протеомика для разработки и скрининга ряда новых ингибиторов, нацеленных на SLC15A4, важнейший воспалительный трансмембранный белок, высоко экспрессируемый в антигенпрезентирующих клетках. При первоначальном нацеливании на потенциальные ингибиторы использовалась стратегия библиотеки зондов полностью функционализированного фрагмента (FFF), идентифицирующая FFF-21 как мощный ингибитор продукции IFN-α среди многочисленных зондов. Последующая структурная оптимизация привела к разработке соединения AJ 2-30, которое не только продемонстрировало превосходное ингибирование, но также подтвердило, что SLC15A4 является его основной целевой модификацией после фотосшивки. Дальнейшие исследования показали, что AJ 2-30 оказывает мощное противовоспалительное действие, снижая стабильность SLC15A4, вызывая его деградацию по лизосомальному пути и эффективно ингибируя активацию TLR 7-9 и NOD. Это исследование не только успешно открывает ингибиторы SLC15A4 со значительной противовоспалительной активностью, но также открывает путь для разработки новых противовоспалительных препаратов.

фото_20240327105242

Маршрут исследования

фото_20240327105942

Экспериментальный процесс

1. Стратегия библиотеки зондов полнофункционализированного фрагмента (FFF) для скрининга ингибиторов SLC15A4.

Авторы начали свое исследование с скрининга ингибиторов SLC15A4 с использованием библиотеки зондов полностью функционализированного фрагмента (FFF). Этот FFF состоит из двух компонентов: одна группа молекулярного распознавания, содержащая фрагменты таблеток, предназначенные для нацеливания на SLC15A4, и другая обогащенная фотосшивкой группа, содержащая двойные акримидиновые и алкиновые группы для визуализации SLC15A4. Используя рабочий процесс химической протеомики, авторы подтвердили связывание этой библиотеки зондов FFF с SLC15A4 в клетках и оценили, может ли зонд FFF снижать уровни IFN-α в клетках, стимулированных TLR 9. Результаты показали, что среди всех зондов FFF, связывающихся с SLC15A4, FFF-21 продемонстрировал наибольшую способность ингибировать уровни IFN-α, а его немаркированный аналог FFF-21c также продемонстрировал аналогичные ингибирующие эффекты.

640 (17)

2. Фотосшивающая модификация ингибиторов SLC15A4.

После первоначального выбора соединения FFF-21c авторы приступили к оптимизации его структуры. Путем синтеза нескольких аналогов FFF-21c они определили AJ 2-30 как наиболее мощный ингибитор. Используя методы фотосшивки, они подтвердили его взаимодействие с мишенью. Впоследствии, используя как метод прямого мечения, так и метод непрямой конкуренции ABPP, а также анализ клеточного термического сдвига (CETSA), авт. окончательно установили SLC15A4 в качестве основной мишени AJ 2-30.

 

640 (18)

3. Противовоспалительный механизм показывает, что AJ 2-30 нарушает стабильность SLC15A4.

После подтверждения связывания AJ 2-30 с SLC15A4 и его ингибирующего эффекта авторы провели серию биохимических экспериментов, чтобы выяснить противовоспалительный механизм AJ 2-30. Результаты показали, что AJ 2-30 индуцирует опосредованную лизосомами деградацию SLC15A4 путем дестабилизации белка, тем самым ингибируя активацию TLR 7-9 и NOD в иммунных клетках SLC15A4-зависимым образом. Это подчеркивает потенциал AJ 2-30 в лечении воспалительных и аутоиммунных заболеваний.

 

Таким образом, в этом исследовании умело используются методы химической протеомики для идентификации AJ 2-30, мощного ингибитора SLC15A4 с замечательной противовоспалительной активностью. Это соединение демонстрирует значительную эффективность на животных моделях, специфически воздействуя на стабильность SLC15A4 и его роль в презентации антигена и воспалительных сигнальных путях. Это важнейшее достижение не только расширяет наше понимание целей противовоспалительной терапии, но и закладывает прочную основу для будущей разработки новых терапевтических средств для лечения различных воспалительных и аутоиммунных заболеваний. Благодаря дальнейшим исследованиям и клинической проверке эти новые ингибиторы SLC15A4 смогут предложить более точные и эффективные варианты лечения для множества пациентов, тем самым оказав глубокое влияние на глобальное здравоохранение.