Продукты
Идентификация сайта связывания нековалентных низкомолекулярных лекарств в живых клетках
На клеточном уровне непосредственное изучение механизма действия лекарств на целевые белки может помочь избежать изменений в структуре белков во время очистки и ложноположительных результатов, которые могут возникнуть из-за искусственных буферных систем и высоких концентраций лекарственного белка.
Техническая платформа
ChomiX предоставляет услуги химической протеомики с использованием биологически активных фотореактивных химических зондов (с активностью, аналогичной молекулам лекарств). Эти зонды инкубируются с клетками или тканями, имеющими отношение к заболеванию, при физиологически значимых концентрациях лекарств с последующей технологией быстрой фотосшивки in situ для преобразования нековалентных взаимодействий между молекулами-зондами лекарственного средства и белками-мишенями в ковалентные взаимодействия. Впоследствии, с помощью таких этапов, как обогащение целевого белка, ферментативное расщепление для высвобождения немодифицированных пептидных сегментов и селективное обогащение пептидных сегментов, модифицированных зондом молекулы лекарственного средства, в сочетании с масс-спектрометрией биомолекул с высоким разрешением, можно быстро определить информацию о последовательности пептидов. Наконец, инструменты молекулярного стыковки используются для быстрого получения моделей связывания лекарств с целевыми белками, обеспечивая надежную поддержку для последующих исследований в области медицинской химии.
Наши преимущества
1. Техническое совершенство: опытная команда, ведущие журнальные публикации и авторитетные отраслевые услуги.
2. Основная патентная технология: эксклюзивные патенты и передовое оборудование для поддержки ранней разработки лекарств.
3. Комплексное обслуживание: охватывает разработку зондов, синтез, обнаружение целей, биоинформатический анализ и своевременную обратную связь о ходе работы для удовлетворения потребностей клиентов.
4. Строгий контроль качества: сертификация ISO9001 гарантирует достоверность и достоверность отчетов.
Наш сервис
| Проект | Идентификация карманов связывания нековалентных низкомолекулярных лекарств |
| Образец | Чистый белок, клеточный лизат, живые клетки, больные ткани, кровь, бактерии, растительные ткани. |
| Аппаратная платформа | Бесконтактный ультразвуковой измельчитель клеток, система визуализации ChemiDoc MP, масс-спектрометр Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Продолжительность проекта | 2-4 недели |
| Результаты | Отчет о проекте (включая экспериментальные процедуры, диаграммы анализа данных, результаты биоинформатического анализа) |
| Цена | Нажмите, чтобы проконсультироваться |
Тематическое исследование
Мишенью молекулы-кандидата в лекарственное средство B является мультитрансмембранный белок с множеством карманов для связывания лекарственного средства. Несмотря на многочисленные попытки использования методов структурной биологии, таких как рентген и крио-ЭМ, модель связывания между молекулой лекарства и целевым белком получить не удалось.
Основываясь на структуре и активности молекулы-кандидата на лекарственное средство B, наша компания разработала и синтезировала фотореактивный химический зонд Probe B, содержащий фотореактивные и биоортогональные группы. Используя платформу для обнаружения целей химической протеомики, упомянутую выше, целевые белки были сначала проверены в клеточных линиях, имеющих отношение к активности молекулы-кандидата лекарства B. Впоследствии, используя основанную на масс-спектрометрии технологию идентификации нековалентных карманов, связывающих лекарство, пространственно соседние пептидные сегменты были определены карманы связывания лекарственного средства и предоставлена модель связывания лекарственного средства с белком.
Анализы иммуноблоттинга показали, что молекула-кандидат лекарственного средства B эффективно конкурирует с сигналами мечения зонда в клетках, что указывает на прямое связывание между молекулой-кандидатом лекарственного средства и целевым белком.
Поскольку химические зонды могут сшиваться только с пептидными сегментами, находящимися в непосредственной пространственной близости, последовательность CLPFIIGCNPTILHVHELYIR была идентифицирована с помощью тандемной масс-спектрометрии высокого разрешения для определения сшитых пептидных сегментов.
