Понимание структуры и взаимодействий белков имеет важное значение для раскрытия их биологических функций. Из-за сложности протеома ни один метод не может полностью раскрыть эти аспекты. Биологи часто используют комбинацию методов, причем масс-спектрометрия сшивки (XL-MS) отличается своими уникальными преимуществами.
XL-MS предоставляет точную информацию о пространственном расстоянии между аминокислотными остатками и предлагает множество преимуществ: минимальные требования к образцу, низкие требования к окружающей среде, отсутствие ограничений по молекулярной массе, сшивка in situ, простота использования и обширный вывод данных.
Технология XL-MS ChomiX использует различные химические сшивающие агенты для нацеливания на определенные аминокислотные остатки, точного сшивания и анализа взаимодействий белок-белок и антитело-антиген.
Обычные химические сшивающие агенты (как показано на рисунке ниже) могут ковалентно сшивать определенные аминокислотные остатки при добавлении в белковые системы. После ферментативного расщепления образуются сшитые пептиды, представляющие собой области взаимодействия между белками. Посредством масс-спектрометрической идентификации и точного анализа пептидных последовательностей можно получить информацию об областях взаимодействия.
Амино-тиоловый сшивающий агент BS3
Амино-сульфгидрильный сшивающий агент EMCS
1. Профессиональное мастерство: наша команда может похвастаться обширным опытом и публикациями в ведущих журналах, предлагая ведущие в отрасли технические услуги.
2. Эффективные решения. Мы используем надежные методы для быстрого продвижения проектов, предоставляя беспроблемные решения.
3. Строгий контроль качества. Наша зрелая система управления качеством, соответствующая стандартам ISO 9001, обеспечивает подлинность и надежность наших отчетов.
4. Систематическое управление проектом: от консультации до предоставления отчета, мы предоставляем своевременную информацию о ходе работ, обеспечивая удовлетворенность клиентов и эффективное выполнение проекта.
5. Новейшее оборудование. Оснащенные современными масс-спектрометрами, такими как Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 и Bruker timsTOF, мы проводим новаторские исследования.
Проект | Идентификация областей взаимодействия белок-белок и антитело-антиген. |
Образец | Чистый белок, комплекс антитело-антиген. |
Аппаратная платформа | Бесконтактный ультразвуковой измельчитель клеток, система визуализации ChemiDoc MP, масс-спектрометр Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Продолжительность проекта | 2-4 недели |
Результаты | Отчет о проекте (включая экспериментальные процедуры, диаграммы анализа данных, результаты биоинформатического анализа) |
Цена | Нажмите, чтобы проконсультироваться |
В этом случае сывороточный белок BSA перекрестно сшивался с использованием аминореактивного сшивающего агента BS3 для создания димерной структуры сывороточного белка BSA. Масс-спектрометрический анализ димерной структуры выявил сегменты сшитого пептида, которые соответствовали существующим литературным данным, тем самым подтвердив точность и надежность эксперимента.
Фактически обнаруженные сшитые пептиды соответствуют сшитым пептидам, представленным в следующей литературе:Характеристика разворачивания белка с помощью масс-спектрометрии быстрой сшивки с использованием сшивающих агентов на основе диортофталевого альдегида. Природные коммуникации, 13 (1), 1468.