Продукты
Хемопротеомическое открытие новых свинцовых структур для неизлечимых мишеней
Техническое образование
В настоящее время только около 800 белков подвергаются воздействию одобренных FDA лекарств, а большое количество мишеней, связанных с болезнями, «не поддаются лечению».Потому что в настоящее время большинство технологий основаны на очищенных белках.Появление химпротеомики произвело революцию в открытии лекарств от очищенных белков до живых клеток.Он способен количественно анализировать взаимодействия между небольшими молекулами и белками в масштабе протеома человека.Теперь открытие ковалентных структур против определенных аминокислотных остатков белков-мишеней, таких как цистеин, лизин, метионин и тирозин, было продемонстрировано в клеточных лизатах и живых клетках.ChomiX будет использовать собственную платформу химиопротеомики, чтобы быстро преодолеть барьеры «непреодолимых» целей.
Технические преимущества
Технические характеристики платформы
Платформа DIA-ABPP предназначена для обнаружения ковалентных связующих, которые взаимодействуют с белками-мишенями посредством ковалентных реакций с тиоловой группой остатков цистеина.Как только активные цистеиновые остатки белков будут преимущественно заняты ковалентными молекулами, будет конкурировать метка универсального зонда, специфически реагирующего с тиоловой группой.В сочетании с методами количественной протеомики на основе DIA можно количественно оценить интенсивность меченных зондом пептидов между ковалентной молекулой и контрольной группой.Эти различия сигналов представляют собой степень заполнения ковалентных молекул относительно их связывающих белков.В отличие от традиционных стратегий скрининга одной цели, платформа DIA-ABPP позволяет проводить количественный анализ взаимодействий между фрагментными электрофилами и почти всеми белками в живых клетках с разрешением по аминокислотным остаткам, что значительно повышает эффективность и снижает риск для проекта по открытию высокопроизводительных ведущих структур. .
Рабочий процесс скрининга соединений ковалентного свинца
Особенность 1
Наша библиотека молекул, подобных лекарствам, содержит множество реактивных групп (боеголовок), характеризующихся умеренной электрофильной реакционной способностью, таких как акриламид, хлорацетамид и алкинамид.Эти молекулы имеют структурно разнообразные фармакофоры, которые соответствуют правилу пяти Липински.
Особенность 2
В настоящее время библиотека белков-мишеней, захватываемых тиол-специфичным химическим зондом, охватывает 39962 сайта цистеина из 12421 белка, включая киназу, фосфатазу, лигазы и факторы транскрипции.Библиотека постоянно обновляется, обеспечивая доступ к самой последней информации о конкретных объектах и объектах.Подробную информацию о конкретных целях и объектах можно получить по ссылке ниже.
Функция 3
В ходе одного скринингового эксперимента платформа способна количественно оценить целевое взаимодействие малых молекул (A2-H6) со всеми мечеными белками во всем протеоме.На рисунке выше показано заселение выбранных клинически важных мишеней ковалентными молекулами.Чем темнее цвет, тем выше заселенность молекулами карманов связывания, включая ортостерические и аллостерические сайты (звездочка указывает, что степень заполнения превышает 80%).Таким образом, сродство и селективность каждой молекулы можно оценить одновременно для последующей оптимизации структуры.