Многие активные низкомолекулярные соединения, такие как метаболиты, натуральные продукты и молекулы лекарств, динамически и обратимо взаимодействуют с белками-мишенями нековалентным образом. Когда белки инактивируются во время исследований in vitro, это может нарушить их связывающие взаимодействия. Технология фотоаффинного мечения (PAL) широко используется в области идентификации мишеней малых молекул, визуализации клеточного распределения и мечения белков. PAL — это распространенный метод ковалентного захвата взаимодействий малых молекул с биомолекулами. При стимуляции ультрафиолетовым светом фотореактивные группы химических зондов (классификация и характеристики приведены в таблице ниже) генерируют радикалы, нитрены или карбены, которые могут быстро и ковалентно метить соседние биомолекулы. Среди них структура диазирина наиболее широко используется в фотоаффинных биоортогональных зондах с малыми молекулами из-за ее высокой биосовместимости, небольшой химической структуры и высокой скорости реакции.

Репрезентативными продуктами являются следующие: