Продукты

Общепротеомное профилирование препаратов, направленных на деградацию белка (TPD)

Технические характеристики платформы

Препарат «Протеолиз, нацеленный на химеры» (ПРОТАК) представляет собой бифункциональную молекулу, которая может связываться с целевым белком и задействовать лигазу убиквитина Е3 для деградации.Таким образом, новые методы, такие как PROTAC и молекулярный клей, обладают способностью непреднамеренно изменять количество эндогенных белков, что обеспечивает новый терапевтический метод для белков-мишеней, особенно для белков, не поддающихся лекарственному воздействию.Комплексное количественное определение содержания белков, включенных и нецелевых, было одним из стандартных экспериментов при исследованиях и разработках лекарств TPD.

Рабочий процесс

Платформа следует структурированному рабочему процессу, начиная с извлечения клеточного лизата, последующего расщепления протеаз, изотопной маркировки и заканчивая масс-спектрометрическим обнаружением.

Тематическое исследование

Цель проекта

Были спроектированы и синтезированы две молекулы ПРОТАК.Входящие и нецелевые белки необходимо проанализировать для сравнения селективности.

Экспериментальный метод

Для протеомного анализа использовали количественный метод МС на основе ТМТ.

В общей сложности 5900 белков были количественно определены в линиях опухолевых клеток, а мишени ON и OFF были идентифицированы для молекул PROTAC1 и 2 (масс-спектрометр Orbitrap Exploris 480, TMT10plex и анализ данных с помощью PD 2.5).