Ковалентные препараты в основном действуют путем образования ковалентных связей со специфическими аминокислотными остатками белков-мишеней, таких как цистеин, лизин и серин. Аспирин — одна из первых известных ковалентных молекул лекарств. Кроме того, многие натуральные продукты обладают ковалентными свойствами, например оридонин, обладающий противовоспалительной биологической активностью. В последние годы ковалентные таргетные препараты привлекают все большее внимание фармацевтических компаний. На сегодняшний день FDA одобрило как минимум шесть ковалентных препаратов, нацеленных на киназы, включая ибрутиниб, который нацелен на киназу BTK.
При обнаружении ковалентных мишеней лекарств в клетках или тканях эффективной стратегией является химическая модификация активных малых молекул путем введения репортерных групп (таких как биотин или биоортогональные группы). Эта модификация, сохраняя первоначальную активность молекулы, позволяет напрямую захватывать взаимодействующие белки-мишени в живых клетках или тканях. Однако многие активные молекулы сложно модифицировать химически, или продукты, образующиеся после реакции с аминокислотными остатками, нестабильны, что делает их непригодными для масс-спектрометрического обнаружения. Чтобы преодолеть эти проблемы, ChomiX предлагает решение: идентификация сайта модификации с использованием конкурентного мечения с помощью зондов, специфичных для аминокислот.
Наша технологическая платформа основана на универсальном химическом зонде, специфичном для аминокислот. Когда активная небольшая молекула реагирует с аминокислотным остатком и занимает сайт связывания, этот универсальный химический зонд генерирует значительную разницу сигналов для этого сайта связывания по сравнению с пустыми контрольными образцами. Обнаружив эти различия в сигналах мечения, мы можем точно получить информацию о целевых белках и аминокислотных остатках активной молекулы, включая как ожидаемые (целевые), так и потенциальные нецелевые белки. Эта технологическая платформа обеспечивает надежную поддержку целевого открытия ковалентных лекарств и исследований механизмов действия лекарств.
1. Техническое совершенство: опытная команда, ведущие журнальные публикации и авторитетные отраслевые услуги.
2. Основная патентная технология: эксклюзивные патенты и передовое оборудование для поддержки ранней разработки лекарств.
3. Комплексное обслуживание: охватывает разработку зондов, синтез, обнаружение целей, биоинформатический анализ и своевременную обратную связь о ходе работы для удовлетворения потребностей клиентов.
4. Строгий контроль качества: сертификация ISO9001 гарантирует достоверность и достоверность отчетов.
Проект | Количественный анализ занятости и селективности мишеней ковалентных низкомолекулярных лекарственных средств |
Образец | Чистый белок, клеточный лизат, живые клетки, больные ткани, кровь, бактерии, растительные ткани. |
Аппаратная платформа | Бесконтактный ультразвуковой измельчитель клеток, система визуализации ChemiDoc MP, масс-спектрометр Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Продолжительность проекта | 2-4 недели |
Результаты | Отчет о проекте (включая экспериментальные процедуры, диаграммы анализа данных, результаты биоинформатического анализа) |
Цена | Нажмите, чтобы проконсультироваться |
AMG510, разработанный Amgen, является первым в мире таргетным препаратом для лечения опухолей с мутацией KRAS-G12C. Этот проект направлен на проверку его целевой специфичности и селективности в соответствующих мутантных клетках. Используя платформу DIA-ABPP компании Chomix, мы провели всесторонний скрининг ковалентных мишеней AMG510 в клетках вплоть до уровня аминокислотных остатков.
Экспериментальные данные показывают, что в четырех повторных экспериментах на клетках NCI-H358 было систематически проанализировано в общей сложности 16 992 остатка цистеина из 5768 белков. При обработке 1 мкМ AMG510 сайт KRAS_C12 показал значительные изменения, в то время как KRAS_C80 остался незатронутым, что дает убедительные доказательства высокой специфичности AMG510 по отношению к мутантному сайту KRAS-G12C (отмечен звездочкой, указывающей целевой сайт остатка цистеина).