Ковалентные лекарства в первую очередь оказывают свое действие путем образования ковалентных связей со специфическими аминокислотными остатками на белках-мишенях, включая цистеин, лизин, серин и другие. Аспирин был первой обнаруженной ковалентной молекулой лекарственного средства, и несколько типичных ковалентных лекарств с противовоспалительной биологической активностью существуют в натуральных продуктах, таких как артемизинин. В последние годы ковалентные таргетные препараты привлекли широкое внимание фармацевтических компаний. В настоящее время FDA одобрено как минимум шесть ковалентных препаратов, нацеленных на киназу, например ибрутиниб, воздействующий на киназу BTK.
Эффективным подходом к обнаружению ковалентных мишеней лекарственных средств в клетках или тканях является химическая модификация активных малых молекул путем введения репортерных групп (таких как биотин, биоортогональные группы и т. д.). Сохраняя исходную активность небольшой молекулы, эта модификация позволяет нам напрямую захватывать взаимодействующие с ней белки-мишени в живых клетках или тканях. Впоследствии, посредством обогащения, ферментативного расщепления, масс-спектрометрической идентификации и анализа данных, можно получить омическую информацию о мишенях и информацию об аминокислотных остатках, касающуюся действия малых молекул. Однако на практике многие активные молекулы нелегко химически модифицировать, а продукты, образующиеся после взаимодействия с аминокислотными остатками, нестабильны, что делает их непригодными для масс-спектрометрического обнаружения. В ответ на эти проблемы SciCorpBio предлагает эффективное решение — конкурентоспособную идентификацию объектов.
Наша технологическая платформа основана на универсальном химическом зонде. Когда активная небольшая молекула реагирует с аминокислотным остатком и занимает сайт связывания, этот универсальный химический зонд генерирует значительную разницу сигналов для этого сайта связывания по сравнению с пустыми контрольными образцами. Обнаружив эти различия в сигналах мечения, мы можем точно получить информацию о целевых белках и аминокислотных остатках активной молекулы, включая как ожидаемые (целевые), так и потенциальные нецелевые белки. Эта технологическая платформа обеспечивает надежную поддержку целевого открытия ковалентных лекарств и исследований механизмов действия лекарств.
1. Техническое совершенство: опытная команда, ведущие журнальные публикации и авторитетные отраслевые услуги.
2. Основная патентная технология: эксклюзивные патенты и передовое оборудование для поддержки ранней разработки лекарств.
3. Комплексное обслуживание: охватывает разработку зондов, синтез, обнаружение целей, биоинформатический анализ и своевременную обратную связь о ходе работы для удовлетворения потребностей клиентов.
4. Строгий контроль качества: сертификация ISO9001 гарантирует достоверность и достоверность отчетов.
Проект | Количественный анализ занятости и селективности мишеней ковалентных низкомолекулярных лекарственных средств |
Образец | Чистый белок, клеточный лизат, живые клетки, больные ткани, кровь, бактерии, растительные ткани. |
Аппаратная платформа | Бесконтактный ультразвуковой измельчитель клеток, система визуализации ChemiDoc MP, масс-спектрометр Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Продолжительность проекта | 2-4 недели |
Результаты | Отчет о проекте (включая экспериментальные процедуры, диаграммы анализа данных, результаты биоинформатического анализа) |
Цена | Нажмите, чтобы проконсультироваться |
AMG510, разработанный Amgen, является первым в мире таргетным препаратом для лечения опухолей с мутацией KRAS-G12C. Целью этого проекта является проверка его целевой специфичности и селективности в соответствующих мутантных клетках. Используя платформу DIA-ABPP компании Chomix, мы провели всесторонний скрининг ковалентных мишеней AMG510 в клетках вплоть до уровня аминокислотных остатков.
Экспериментальные данные показывают, что в четырех повторных экспериментах на клетках NCI-H358 было систематически проанализировано в общей сложности 16 992 остатка цистеина из 5768 белков. При обработке 1 мкМ AMG510 сайт KRAS_C12 показал значительные изменения, в то время как KRAS_C80 остался незатронутым, что дает убедительные доказательства высокой специфичности AMG510 по отношению к мутантному сайту KRAS-G12C (отмечен звездочкой, указывающей целевой сайт остатка цистеина).