-
Хемопротеомическое профилирование белковых мишеней нековалентных низкомолекулярных препаратов
Нековалентные взаимодействия, такие как водородные связи и π-π-укладка, могут быть нарушены из-за денатурации белка. Чтобы решить эту проблему, платформа ChomiX использует фотоаффинное мечение — хорошо зарекомендовавший себя метод точного прикрепления «химических меток» к активному сайту белка. Более того, инновационная стратегия химического сшивания ChomiX in situ преобразует временные нековалентные взаимодействия белков в ковалентные и постоянные химические связи. Используя химический зонд, который функционализирован как фотоаффинными, так и биоортогональными фрагментами, платформа хемопротеомики ChomiX продемонстрировала свою эффективность в успешном вылове белковых мишеней в клеточных лизатах, тканях и живых клетках. Спектр биоактивных низкомолекулярных препаратов, применяемых на платформе, включает множество соединений, включая эндогенные метаболиты, натуральные продукты и нековалентные синтетические молекулы.
-
Конкурентное хемопротеомное профилирование белковых мишеней для ковалентных низкомолекулярных препаратов
Подобно нековалентным лекарствам, стратегия прямого извлечения с использованием химических зондов, функционализированных репортерными группами, также была успешно продемонстрирована для ковалентных низкомолекулярных лекарств. Однако стоит отметить, что некоторые ковалентные препараты непереносимы к химическим модификациям из-за потери биологической активности или синтетической недоступности. Кроме того, образовавшаяся ковалентная связь обычно нестабильна при МС-детектировании.
Конкурентная хемопротеомная стратегия является идеальной альтернативой, которая использует универсальный зонд на основе активности для мечения белков. Были разработаны специальные химические зонды для взаимодействия с остатками цистеина, лизина, серина и гистидина. В принципе, когда аминокислотный остаток занят небольшой ковалентной молекулой, он не может быть помечен зондом. В результате, с помощью этой конкурентной стратегии с разрешением аминокислоты можно было всесторонне идентифицировать ВКЛЮЧЕННЫЕ и ВЫКЛЮЧЕННЫЕ мишени.
-
Хемопротеомическое открытие новых свинцовых структур для неизлечимых мишеней
Хемопротеомическое открытие новых свинцовых структур для неизлечимых мишеней Техническая информация В настоящее время только около 800 белков являются мишенями одобренных FDA лекарств, и большое количество мишеней, связанных с болезнями, являются «неизлечимыми». Потому что в настоящее время большинство технологий основаны на очищенных белках. Появление химпротеомики произвело революцию в открытии лекарств от очищенных белков до живых клеток. Он способен количественно анализировать взаимодействия между небольшими молекулами и...
