Cystein Post-Translational Modifieringar Omics Analys

Cystein, med sin anmärkningsvärda reaktivitet, spelar en avgörande roll i proteinstruktur och funktion. Fungerar som ett nukleofilt reagens, redoxkatalytiskt centrum, metalljonligand och nyckelställe för konformationsförändringar, och deltar i stor utsträckning i och påverkar djupt proteinaktivitet och regleringsmekanismer. Det är värt att notera att cysteinrester är benägna att genomgå olika typer av posttranslationella modifieringar (PTM), som inte bara finjusterar proteinfunktionella egenskaper utan också kan leda till funktionsnedsättning. Med tanke på det nära sambandet mellan sådana modifieringar och många stora mänskliga sjukdomar, är kvalitativ och kvantitativ analys av cystein-PTM i proteiner av största vikt. Detta har ett oumbärligt värde för en fördjupad förståelse av de biologiska funktionerna hos relevanta proteiner och deras verkningsmekanismer i hälso- och sjukdomstillstånd.

Chomix har rik erfarenhet av identifiering av cysteinmodifieringar, såsom cysteinpersulfidering. Genom att innovativt använda universella cysteinsonder baserat på skillnaden i pKa mellan -SH och -SSH, justerar vi pH för att minska bakgrundsinterferensen från -SH, vilket gör att sonderna huvudsakligen kan märka -SSH och därmed effektivt identifiera sulfenyleringsställen.

Chomix har avancerad masspektrometriteknik som kan direkt och exakt lösa olika typer av proteinposttranslationella modifieringar och deras specifika platser. Genom smart integrering av separations- och anrikningstekniker med isotopmärkning och andra avancerade metoder möjliggör vi storskalig, hög genomströmning kvalitativ och kvantitativ analys av olika modifieringar, vilket ger robust tekniskt stöd för djupgående forskning om protein post-translationella modifieringar.

Våra fördelar

1. Professionell expertis: Med lång erfarenhet och publikationer i ledande tidskrifter erbjuder vi skräddarsydda tjänster för optimala resultat.

2. Rigorös kvalitetsledning: Våra mogna kvalitetssystem följer ISO9001-standarderna, vilket säkerställer tillförlitliga rapporter.

3. Omfattande tjänst: Från sonddesign till bioinformatikanalys, vi tillhandahåller allt-i-ett-konsultation till leverans, med aktuella framstegsuppdateringar.

4. Avancerad utrustning: Utrustad med banbrytande masspektrometrar som Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 och Bruker timsTOF, stödjer vi banbrytande forskning.

Vår tjänst

Projekt	Cystein Post-Translational Modifieringar Omics Analys
Prov	Rent protein, cellysat, levande celler, sjuk vävnad, blod, bakterier, växtvävnad
Hårdvaruplattform	Beröringsfri ultraljudscellpulveriserare，ChemiDoc MP Imaging System，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 masspektrometer
Projektets varaktighet	4-8 veckor
Leveranser	Projektrapport (inklusive experimentella procedurer, dataanalysdiagram, bioinformatikanalysresultat)
Pris	Klicka för att konsultera

Fallstudie

Tiolering avser kopplingen av en tiolgrupp (-SSH) till cysteinrester i proteiner, medierad av vätesulfid (H2S). För att undersöka denna process ytterligare kan hela proteomer extraheras från cell- eller vävnadsprover och märkas med en kemisk sondmetod (cysteinspecifik sond). Till skillnad från tiolinterferens möjliggör denna metod effektiv märkning av tiolgrupper genom att justera pH exakt. Därefter, med hjälp av högupplöst masspektrometri, kan forskare exakt identifiera platser för tiolering, och därigenom ytterligare belysa den viktiga rollen för denna post-translationella modifiering in vivo.

Med hjälp av HeLa-cellmodeller extraherades först hela proteomet. Därefter möjliggjorde modellering med NaHS och pH-justering noggrann märkning av tiolgrupper med en universell cysteinsond. Genom en serie steg inklusive anrikning, enzymatisk nedbrytning och masspektrometrisk detektion, identifierades 180 peptider innehållande -SSH-modifieringar, tillsammans med 120 relaterade proteiner, inklusive de rapporterade tioleringsställena GAPDH_C152 och C247.