Vår vetenskapliga plattform,ChomiX skärm, som är baserad på DIA-ABPP (Data Independent Acquisition-Activity Based Protein Profiling), är en viktig del av vår ABPP-ledande metodik. Genom vårChomiX skärmteknologiplattform, kan vi screena kovalenta blyföreningar för ohärdiga mål. Den specifika processen inkluderar kovalent molekylbehandling av levande celler, separation och anrikning av kemiska sondmärkta peptider, högupplöst masspektrometridetektion och konstruktion av ett läkemedels-målställe-bindande nätverk. Detta gör det möjligt för oss att utvärdera bindningsförmågan och selektiviteten hos läkemedel för specifika aminosyrarester på flera proteinmål samtidigt, vilket genererar kandidatföreningar. För närvarande har vi byggt ett omfattande proteinmålbibliotek, inklusive det största inhemska biblioteket av kovalenta föreningar riktade mot cystein , baserat på vårt kemiska sondbibliotek och andra karakteristiska kärnmoduler.
Beläggningshastigheten för bindningsstället (Protein_Cys-ställe) för varje förening bestäms med användning av massspecifikationsintensiteterna för kvantifierade sondmärkta peptider. I huvudsak konkurrerar den cysteinspecifika sonden med föreningar för att binda till en viss bindningsficka. Ju lägre signal den sondmärkta peptiden har, desto starkare är föreningens beläggningsförmåga. För varje cysteinställe i proteinet av intresse (POI) utförs bestämningen av dosberoende målengagemangsförhållanden (TE50) för utvalda föreningar. Träffkandidater bekräftas sedan genom rankningen av deras TE50-värden. Ju lägre TE50, desto starkare upptar föreningen cysteinstället för POI i levande celler.
