Produkter
Identifiering och selektivitetsanalys av proteinnedbrytande mål
Under de senaste åren har riktad proteinnedbrytning (TPD) dykt upp som en innovativ terapeutisk strategi som syftar till att modulera sjukdomar genom att intervenera i proteinuttryck med hjälp av läkemedelsmolekyler. Bland dessa tillvägagångssätt har proteolysinriktade chimärer (PROTAC) fått stor uppmärksamhet. Konceptet med PROTAC föreslogs först av Crews et al. 2001, med kärnidén att utnyttja det endogena ubiquitin-proteasomsystemet för att bryta ned målproteiner och därigenom uppnå terapeutiska mål. På grund av deras höga aktivitet, förmåga att rikta in sig på "odugliga" proteiner och att övervinna läkemedelsresistens har PROTAC blivit ett hett ämne inom läkemedelsutveckling, med stora läkemedelsföretag som Pfizer, Bayer och Merck aktivt involverade i forskning och utveckling inom detta område .
Förutom PROTAC:er finns det flera liknande strategier, inklusive molekylära limnedbrytare som använder ubiquitin-proteasomsystemet, lysosomriktande chimärer (LYTACs) som använder endosom-lysosomvägen, såväl som autofagiriktande chimärer (AUTACs) och autofagosombindningsföreningar (ATTECs) ) med användning av autofagi-lysosomvägen. Dessa tillvägagångssätt banar väg för nya vägar inom sjukdomsbehandling.
Ett viktigt utvärderingskriterium vid utvecklingen av sådana molekyler är dock om de kan bryta ned målproteiner specifikt utan att påverka mängden andra proteiner i cellen. För att uppnå detta mål spelar kvantitativ proteomikteknologi en avgörande roll. Denna teknologi möjliggör kvantitativ jämförelse av mängden av samma protein över olika prover på proteomnivå med hjälp av högupplöst masspektrometri. För närvarande innebär en vanlig kvantitativ proteomikstrategi införande av stabila isotopmärkningar under beredning av peptidprov. Under masspektrometridetektion uppvisar peptider med samma aminosyrasekvens men från olika prover olika mass-till-laddning-förhållanden på grund av skillnaden i massan av isotopmärkningen. Därför kan förhållandet mellan sameluerade joner av samma peptidsekvens kvantitativt återspegla mängden av samma protein i olika prover. Denna strategi förbättrar inte bara effektiviteten av provberedning och masspektrometridatainsamling utan minskar också experimentella fel mellan prover, vilket gör resultaten mer stabila och tillförlitliga.
Teknisk plattform
Chomix har utvecklat en mängd olika kvantitativa teknologiplattformar för kemisk proteomik. Dess innovativa plattformar möjliggör exakt kvalitativ och kvantitativ analys av över 5 000 proteiner i en enda cellinje, vilket ger robust stöd för omfattande målselektivitetsanalys. Om man tar exemplet med den multikvantitativa proteomikteknologiplattformen baserad på Tandem Mass Tag (TMT)-märkning, extraherar denna teknologi först hela proteomet från cellprover som behandlats med proteinnedbrytare och bearbetar dem sedan genom enzymatisk nedbrytning och multikvantitativa märkningssteg innan blandas ihop. För att förbättra täckningsdjupet för proteomet används vätskekromatografi vanligtvis för förfraktionering av peptidprover, följt av masspektrometridetektion av varje peptidprov, vilket gör en djupgående analys av skillnader i proteinöverflöd mellan prover och belyser viktig målinformation och selektivitetsdata. Denna plattform ger utvärdering och vägledning för utveckling och optimering av proteinnedbrytare.
Våra fördelar
1. Teknisk spetskompetens: Erfaret team, tidskriftspublikationer på toppnivå och auktoritativa branschtjänster.
2. Kärnpatentteknik: Exklusiva patent och avancerad hårdvara för tidig läkemedelsutvecklingsstöd.
3. One-stop Service: Täcker sonddesign, syntes, målupptäckt, bioinformatikanalys och snabb återkoppling av framsteg för kundnöjdhet.
4. Rigorös kvalitetsledning: ISO9001-certifiering säkerställer pålitliga och autentiska rapporter.
Vår tjänst
| Projekt | Identifiering och selektivitetsanalys av proteinnedbrytande mål |
| Prov | Cellysat, levande celler |
| Hårdvaruplattform | Beröringsfri ultraljudscellpulveriserare，ChemiDoc MP Imaging System，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 masspektrometer |
| Projektets varaktighet | 3-4 veckor |
| Leveranser | Projektrapport (inklusive experimentella procedurer, dataanalysdiagram, bioinformatikanalysresultat) |
| Pris | Klicka för att konsultera |
Fallstudie
Projektmål: Två PROTAC-molekyler designades och syntetiserades. Proteinerna på och utanför målet måste analyseras för jämförelse av selektivitet.
Experimentell metod: TMT-baserad kvantitativ MS-metod användes för proteomisk analys.
Projektresultat:
Totalt 5900 proteiner kvantifierades i tumörcellinjer och ON & OFF-mål identifierades för PROTAC1 och 2 molekyler (Orbitrap Exploris 480 masspektrometer, TMT10plex och dataanalys av PD 2.5)
