Produkter
Identifiering av bindningsstället för icke-kovalenta småmolekylära läkemedel i levande celler
På cellnivå kan direkt studier av verkningssättet mellan läkemedel och målproteiner hjälpa till att undvika förändringar i proteinstrukturen under rening och falskt positiva resultat som kan uppstå från artificiella buffertsystem och höga läkemedelsproteinkoncentrationer.
Teknisk plattform
ChomiX tillhandahåller kemiska proteomiktjänster som använder biologiskt aktiva fotoreaktiva kemiska sonder (med aktivitet som liknar läkemedelsmolekyler). Dessa prober inkuberas med sjukdomsrelevanta celler eller vävnader vid fysiologiskt relevanta koncentrationer av läkemedel, följt av in situ snabb fototvärbindningsteknologi för att omvandla icke-kovalenta interaktioner mellan läkemedelsmolekylsonder och proteinmål till kovalenta interaktioner. Därefter, genom steg som målproteinanrikning, enzymatisk nedbrytning för att frigöra omodifierade peptidsegment och selektiv anrikning av läkemedelsmolekylsondmodifierade peptidsegment, kombinerat med högupplöst masspektrometri av biomolekyler, kan peptidsekvensinformation snabbt bestämmas. Slutligen används molekylära dockningsverktyg för att snabbt få bindande modeller av läkemedel med målproteiner, vilket ger robust stöd för efterföljande medicinsk kemiforskning.
Våra fördelar
1. Teknisk förträfflighet: Erfaret team, tidskriftspublikationer på toppnivå och auktoritativa branschtjänster.
2. Kärnpatentteknik: Exklusiva patent och avancerad hårdvara för tidig läkemedelsutvecklingsstöd.
3. One-stop Service: Täcker sonddesign, syntes, målupptäckt, bioinformatikanalys och snabb återkoppling av framsteg för kundnöjdhet.
4. Rigorös kvalitetsledning: ISO9001-certifiering säkerställer pålitliga och autentiska rapporter.
Vår tjänst
| Projekt | Identifiering av bindningsfickor för icke-kovalenta småmolekylära läkemedel |
| Prov | Rent protein, cellysat, levande celler, sjuk vävnad, blod, bakterier, växtvävnad |
| Hårdvaruplattform | Beröringsfri ultraljudscellpulveriserare，ChemiDoc MP Imaging System，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 masspektrometer |
| Projektets varaktighet | 2-4 veckor |
| Leveranser | Projektrapport (inklusive experimentella procedurer, dataanalysdiagram, bioinformatikanalysresultat) |
| Pris | Klicka för att konsultera |
Fallstudie
Målet för kandidatläkemedelsmolekyl B är ett multi-transmembranprotein med flera läkemedelsbindande fickor. Trots flera försök med strukturbiologiska metoder som röntgen och kryo-EM kunde en bindningsmodell mellan läkemedelsmolekylen och målproteinet inte erhållas.
Baserat på strukturen och aktiviteten hos läkemedelskandidatmolekyl B, designade och syntetiserade vårt företag en fotoreaktiv kemisk sond, Probe B, som omfattar fotoreaktiva och bioortogonala grupper. Med användning av den kemiska proteomik-målupptäcktsplattformen som nämnts ovan, validerades målproteiner först i cellinjer som är relevanta för aktiviteten av kandidatläkemedelsmolekyl B. Därefter utnyttjade masspektrometribaserad icke-kovalent läkemedelsbindande fickidentifieringsteknologi, de rumsligt intilliggande peptidsegmenten till läkemedelsbindningsfickorna bestämdes och en läkemedelsproteinbindningsmodell tillhandahölls.
Immunoblottinganalyser avslöjade att läkemedelskandidatmolekyl B effektivt konkurrerar med sondmärkningssignaler i celler, vilket indikerar direkt bindning mellan läkemedelskandidatmolekylen och målproteinet.
Eftersom kemiska prober endast kan tvärbinda med peptidsegment i nära rumslig närhet, identifierades sekvensen CLPFIIGCNPTILHVHELYIR genom tandem högupplöst masspektrometri för att bestämma de tvärbundna peptidsegmenten.
