Identifiering av interaktionsregioner för protein-protein- och antikropp-antigen-interaktioner

En djupgående förståelse av proteinstruktur och dess interaktioner är avgörande för att avslöja deras biologiska funktioner. Men på grund av komplexiteten och mångfalden inom proteinområdet, kämpar en enda forskningsteknik ofta för att helt klargöra deras mysterier. Därför antar biologer vanligtvis en strategi för att integrera flera tekniska tillvägagångssätt för att kollektivt utforska den tredimensionella strukturen och dynamiska interaktionsbeteendet hos proteiner. Bland dessa har tvärbindande masspektrometri (XL-MS)-teknologi visat ett enastående forskningsvärde inom detta område på grund av dess unika fördelar. Den kan exakt tillhandahålla information om rumslig avstånd mellan aminosyrarester och har många fördelar, såsom att kräva små provmängder, låga miljökrav för proteiner, inga molekylviktsbegränsningar, enkel tvärbindning in situ, enkel drift och att erhålla en stor mängd information.

Efter mer än tjugo år av kontinuerlig utveckling och teknisk innovation har XL-MS-teknologin gjort betydande framsteg inom experimentell design, dataanalys och andra aspekter, och har nu blivit ett oumbärligt kärnverktyg inom integrerad strukturbiologi. XL-MS-teknologin som används av Coalesce Bio använder olika kombinationer av kemiska tvärbindningsmedel. Dessa medel reagerar med olika aminosyrarester såsom karboxyl-, amino- och sulfhydrylgrupper, vilket möjliggör exakt tvärbindning av protein-protein- och antikropp-antigen-interaktioner, och löser således interaktionsregioner exakt.

Teknisk plattform

Vanliga kemiska tvärbindare (som visas i figuren nedan) kan kovalent tvärbinda specifika aminosyrarester när de sätts till proteinsystem. Efter enzymatisk nedbrytning genereras tvärbundna peptider som representerar interaktionsregionerna mellan proteiner. Genom masspektrometriidentifiering och exakt analys av peptidsekvenserna kan information om interaktionsregionerna erhållas.

Amino-till-tiol tvärbindare BS3

Amino-sulfhydryl tvärbindare EMCS

Våra fördelar

1. Professionell excellens: Vårt team har lång erfarenhet och publikationer i topptidskrifter och erbjuder branschledande tekniska tjänster.
2. Effektiva lösningar: Vi använder pålitliga metoder för att driva projekt framåt snabbt och tillhandahålla bekymmersfria lösningar.
3. Rigorös kvalitetsledning: Genom att följa ISO 9001-standarderna säkerställer vårt mogna kvalitetsledningssystem att våra rapporter är äkta och tillförlitliga.
4. Systematisk projektledning: Från konsultation till rapportleverans tillhandahåller vi snabba framstegsuppdateringar, vilket säkerställer kundnöjdhet och effektivt projektgenomförande.
5. Banbrytande utrustning: Utrustad med avancerade masspektrometrar som Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 och Bruker timsTOF, underlättar vi banbrytande forskning.

Vår tjänst

Projekt	Identifiering av interaktionsregioner för protein-protein- och antikropp-antigen-interaktioner
Prov	Rent protein, antikropp-antigenkomplex
Hårdvaruplattform	Beröringsfri ultraljudscellpulveriserare，ChemiDoc MP Imaging System，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 masspektrometer
Projektets varaktighet	2-4 veckor
Leveranser	Projektrapport (inklusive experimentella procedurer, dataanalysdiagram, bioinformatikanalysresultat)
Pris	Klicka för att konsultera

Fallstudie

I detta fall tvärbands BSA-serumprotein med användning av den aminreaktiva tvärbindaren BS3 för att konstruera en dimer struktur av BSA-serumprotein. Masspektrometrianalys av den dimera strukturen identifierade tvärbundna peptidsegment som matchade befintliga litteraturdata, och validerade därigenom experimentets noggrannhet och tillförlitlighet.