Att förstå proteinstruktur och interaktioner är viktigt för att avslöja deras biologiska funktioner. På grund av proteomets komplexitet kan ingen enskild teknik helt avslöja dessa aspekter. Biologer använder ofta en kombination av metoder, där tvärbindande masspektrometri (XL-MS) utmärker sig för sina unika fördelar.
XL-MS tillhandahåller exakt rumslig avståndsinformation mellan aminosyrarester och erbjuder många fördelar: minimalt provbehov, låga miljökrav, inga molekylviktsbegränsningar, in situ tvärbindning, enkel användning och omfattande datautmatning.
ChomiX:s XL-MS-teknologi använder olika kemiska tvärbindare för att rikta in sig på specifika aminosyrarester, genom att exakt tvärbinda och analysera protein-protein- och antikropp-antigen-interaktioner.
Vanliga kemiska tvärbindare (som visas i figuren nedan) kan kovalent tvärbinda specifika aminosyrarester när de sätts till proteinsystem. Efter enzymatisk nedbrytning genereras tvärbundna peptider som representerar interaktionsregionerna mellan proteiner. Genom masspektrometriidentifiering och exakt analys av peptidsekvenserna kan information om interaktionsregionerna erhållas.
Amino-till-tiol tvärbindare BS3
Amino-sulfhydryl tvärbindare EMCS
1. Professionell excellens: Vårt team har lång erfarenhet och publikationer i topptidskrifter och erbjuder branschledande tekniska tjänster.
2. Effektiva lösningar: Vi använder pålitliga metoder för att driva projekt framåt snabbt och tillhandahålla bekymmersfria lösningar.
3. Rigorös kvalitetsledning: Genom att följa ISO 9001-standarderna säkerställer vårt mogna kvalitetsledningssystem att våra rapporter är äkta och tillförlitliga.
4. Systematisk projektledning: Från konsultation till rapportleverans tillhandahåller vi snabba framstegsuppdateringar, vilket säkerställer kundnöjdhet och effektivt projektgenomförande.
5. Banbrytande utrustning: Utrustad med avancerade masspektrometrar som Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 och Bruker timsTOF, underlättar vi banbrytande forskning.
Projekt | Identifiering av interaktionsregioner för protein-protein- och antikropp-antigen-interaktioner |
Prov | Rent protein, antikropp-antigenkomplex |
Hårdvaruplattform | Beröringsfri ultraljudscellpulveriserare,ChemiDoc MP Imaging System,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 masspektrometer |
Projektets varaktighet | 2-4 veckor |
Leveranser | Projektrapport (inklusive experimentella procedurer, dataanalysdiagram, bioinformatikanalysresultat) |
Pris | Klicka för att konsultera |
I detta fall tvärbands BSA-serumprotein med användning av den aminreaktiva tvärbindaren BS3 för att konstruera en dimer struktur av BSA-serumprotein. Masspektrometrianalys av den dimera strukturen identifierade tvärbundna peptidsegment som matchade befintliga litteraturdata, och validerade därigenom experimentets noggrannhet och tillförlitlighet.
De tvärbundna peptiderna som faktiskt detekteras överensstämmer med de tvärbundna peptiderna som presenteras i följande litteratur-Karakterisering av proteinutveckling genom snabb tvärbindande masspektrometri med användning av di-orto-ftalaldehyd tvärbindare. Nature Communications, 13(1), 1468.