Produkter
Protein Post-translationella modifieringar (PTM) Analys baserad på kemiska sonder
Förutom traditionella antikroppsanrikningsstrategier har kemiska, enzymatiska och metaboliska märkningstekniker successivt tillämpats vid anrikning och identifiering av posttranslationella modifieringar (PTM) i proteiner. Den underliggande principen involverar användning av kemisk reaktion eller enzymkatalys för att kovalent fästa specifika molekylära prober till målmodifieringar eller modifierande rester, följt av proteomisk analys. Detta framväxande tillvägagångssätt inom kemoproteomik blir viktig i studiet av proteinmodifieringar med låg överflöd, såsom palmitoylering, myristoylering och glykosylering. Det erbjuder framför allt fördelen av att vara applicerbart i levande celler, och därigenom kringgå potentiell interferens, såsom oxidation till följd av cellstress.
Teknisk service
1. Cystein post-translationella modifikationer
Cystein (Cys) är en vanlig svavelhaltig aminosyra i proteiner, och dess tiolgrupp spelar avgörande roller för att reglera molekylär redoxhomeostas, påverka enzymatiska reaktioner, protein-proteininteraktioner och proteinstabilitet genom olika post-translationella modifieringsprocesser. Vanliga posttranslationella modifieringar på cystein inkluderar palmitoylering, nitrosylering, sulfenylering och sulfonering. Colosseum Biosciences har utvecklat universella prober eller metaboliska märkningsstrategier riktade mot cysteinrester och etablerat motsvarande kemiska proteomikplattformar för identifiering av post-translationell modifiering. Denna plattform identifierar exakt målproteiner och modifieringsställen för posttranslationella modifieringar.
2. Lysin Post-Translationella modifikationer
Lysin (Lys) är en av aminosyrorna med de mest olika posttranslationella modifieringarna (PTM) i proteomet. Reversibla lysinposttranslationella modifieringar (Lys-PTM) är vanliga biokemiska processer som spelar oumbärliga roller för att reglera många kritiska cellulära funktioner. Posttranslationella modifieringar på lysin inkluderar acetylering, succinylering, propionylering, butyrylering, krotonylering, malonylering och laktylering. Colosseum Biosciences har utvecklat en teknologiplattform för kemisk proteomik baserad på kemiska sonder för lysinposttranslationella modifieringar, som exakt identifierar målproteiner och modifieringsställen.
3. Serin/Treonin Post-Translationella modifikationer
Vanliga posttranslationella modifieringar av serin (Ser) och treonin (Thr) inkluderar främst fosforylering, O-glykosylering, etc. Dessa modifieringar påverkar signifikant aktivitetstillståndet hos proteiner och deras interaktioner med andra molekyler, och spelar viktiga roller i olika viktiga biologiska processer. Därför är analysen av denna typ av post-translationell modifiering ett viktigt ämne inom proteinfunktionsforskning. Colosseum Biosciences använder fosforyleringsberikande material, icke-naturliga kemiska glykansonder och andra verktyg för att exakt identifiera målproteiner och modifieringsställen för denna typ av post-translationell modifiering.
Våra fördelar
01. Mycket professionell:Drivs av forskargruppen av professor Wang Chu från Peking University, chefsforskaren för vårt företag.
02. One-stop-plattform:Omfattar hela arbetsflödet från sonddesign, sondsyntes, målupptäckt till bioinformatikanalys.
03. Inget behov av antikroppar:Specifik kemisk sondmodifiering,Fysiologisk
04. Miljö:Tillämpbar i både lysat och levande celler.
05. Omfattande erfarenhet:Ackumulerad expertis inom över 10 olika typer av PTM
06. Högpresterande plattform:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480,Thermo Fisher Q Exactive HF-X,Bruker timsTOF
Fallstudie
Itaconation hänvisar till den process i vilken itaconate binder kovalent till specifika platser på proteiner under post-translationell modifiering. Denna modifiering kan förändra proteinets struktur och funktion, vilket påverkar dess roll i cellen. Till exempel kan itakonation reglera enzymaktivitet, stabilitet eller interaktioner med andra molekyler. Eftersom itaconate är en mellanprodukt i trikarboxylsyracykeln är denna modifiering nära kopplad till cellens metaboliska tillstånd. Forskning har visat att itakonation spelar en betydande roll i patologin hos vissa sjukdomar, och att förstå denna modifieringsmekanism kan hjälpa till att utveckla nya terapeutiska strategier.
Cellerna metaboliskt märkta med ITalk-prober på levande cellnivå lyserades, följt av klickreaktion, anrikning, enzymdigestion och andra steg för att bestämma den specifika platsen för itakonförsurning.
