-
Kemoproteomisk profilering av proteinmål för icke-kovalenta småmolekylära läkemedel
Icke-kovalenta interaktioner, såsom vätebindningar och π-π-stapling, kan störas på grund av proteindenaturering. För att möta denna utmaning använder ChomiX-plattformen fotoaffinitetsmärkning, en väletablerad teknik för att exakt fästa "kemiska etiketter" till ett proteins aktiva plats. Dessutom omvandlar ChomiX innovativa in situ kemiska tvärbindningsstrategi övergående icke-kovalenta proteininteraktioner till kovalenta och permanenta kemiska bindningar. Genom att använda en kemisk sond som är funktionaliserad med både fotoaffinitet och bioortogonala delar, har ChomiX:s kemoproteomikplattform visat sin effektivitet för att framgångsrikt fiska ut proteinmål inom cellysat, vävnader och levande celler. Spektrum av bioaktiva småmolekylära läkemedel som används i plattformen omfattar en mängd olika föreningar, inklusive endogena metaboliter, naturliga produkter och icke-kovalenta syntetiska molekyler.
-
Konkurrenskraftig kemoproteomisk profilering av proteinmål för kovalenta småmolekylära läkemedel
I likhet med icke-kovalenta läkemedel har den direkta neddragningsstrategin genom att använda kemiska sönder funktionaliserade med reportergrupper också visats framgångsrikt för kovalenta småmolekylära läkemedel. Det är dock värt att notera att vissa kovalenta läkemedel är intoleranta mot kemiska modifieringar på grund av förlust av bioaktivitet eller syntetisk otillgänglighet. Dessutom är den bildade kovalenta bindningen vanligtvis instabil under MS-detektion.
Konkurrenskraftig kemoproteomisk strategi är ett idealiskt alternativ, som använder en universell aktivitetsbaserad sond för proteinmärkning. Specifika kemiska sonder har utvecklats för att reagera med cystein-, lysin-, serin- och histidinrester. I princip, när den väl är upptagen av en kovalent liten molekyl, kan aminosyraresten inte märkas av sonden. Som ett resultat kunde ON och OFF-målen identifieras heltäckande genom denna konkurrenskraftiga strategi med upplösningen av aminosyra.
-
Kemoproteomisk upptäckt av nya blystrukturer för ohärdiga mål
Kemoproteomisk upptäckt av nya ledningsstrukturer för ohärdiga mål Teknisk bakgrund För närvarande har endast ~800 proteiner varit målinriktade av FDA-godkända läkemedel, och ett stort antal sjukdomsrelaterade mål är "odugliga". För för närvarande är de flesta teknologier beroende av renade proteiner. Tillkomsten av chemproteomics har revolutionerat läkemedelsupptäckten från renade proteiner till levande celler. Det är kapabelt att kvantitativt analysera interaktionerna mellan små molekyler och...
