Bizning ilmiy platformamiz,ChomiX ekraniDIA-ABPP (Data Independent Acquisition-Activity Based Protein Profiling) ga asoslangan ABPP yetakchi metodologiyamizning muhim qismidir. Bizning orqaliChomiX ekranitexnologiya platformasida biz kovalent qo'rg'oshin birikmalarini chidab bo'lmas maqsadlar uchun ko'rishimiz mumkin. Muayyan jarayon tirik hujayralarni kovalent molekula bilan davolash, kimyoviy zond bilan etiketlangan peptidlarni ajratish va boyitish, yuqori aniqlikdagi massa spektrometriyasini aniqlash va dori-maqsadni bog'lash tarmog'ini qurishni o'z ichiga oladi. Bu bizga bir vaqtning o'zida bir nechta protein maqsadlarida maxsus aminokislotalar qoldiqlari uchun dorilarning bog'lanish qobiliyatini va selektivligini baholashga imkon beradi va nomzod birikmalarni hosil qiladi. Hozirda biz sisteinga qaratilgan kovalent birikmalarning eng katta mahalliy kutubxonasini o'z ichiga olgan keng qamrovli protein maqsadli kutubxonasini yaratdik. , bizning kimyoviy zond kutubxonamiz va boshqa xarakterli asosiy modullar asosida.
Har bir birikma uchun bog'lanish joyining (Protein_Cys sayti) to'ldirilish darajasi prob-belgilangan peptidlarning massaviy intensivligidan foydalangan holda aniqlanadi. Aslida, sisteinga xos prob ma'lum bir bog'lovchi cho'ntagiga bog'lash uchun birikmalar bilan raqobatlashadi. Zond bilan belgilangan peptidning signali qanchalik past bo'lsa, birikmaning joylashish qobiliyati shunchalik kuchli bo'ladi. Qiziqarli proteinning (POI) har bir sistein joyi uchun tanlangan birikmalar uchun dozaga bog'liq maqsadli ulanish nisbatlarini (TE50) aniqlash amalga oshiriladi. Xit nomzodlar TE50 qiymatlari reytingi orqali tasdiqlanadi. TE50 qanchalik past bo'lsa, birikma tirik hujayralardagi POIning sistein joyini shunchalik kuchli egallaydi.
