Maqsadli oqsil degradatsiyasi (TPD) preparatlari uchun proteom-keng profillash

Maqsadli oqsil degradatsiyasi (TPD) dori uchun proteom-keng profiling

Platformaning texnik xususiyatlari

Proteolizni maqsad qilgan ximeralar (PROTAC) preparati maqsadli oqsil bilan bog'lanishi va ubiquitin E3 ligazasini parchalanish uchun jalb qilishi mumkin bo'lgan ikki funktsiyali molekuladir. Shu sababli, PROTAC va molekulyar elim kabi yangi usullar endogen oqsillarning ko'pligini beixtiyor o'zgartirish qobiliyatiga ega, bu protein maqsadlari, ayniqsa chidamli bo'lmagan oqsillar uchun yangi terapevtik usulni ta'minlaydi. Maqsadli va maqsadli oqsillarning ko'pligini har tomonlama aniqlash TPD dori-darmonlari R&D uchun standart tajribalardan biri bo'ldi.

Ish jarayoni

Platforma hujayra lizatini ekstraksiya qilishdan boshlab, keyinchalik proteaza hazm qilish, izotopik yorliqlashni amalga oshiradigan va massa spektrometriyasini aniqlash bilan yakunlangan tuzilgan ish jarayonini kuzatib boradi.

Case Study

Loyiha maqsadi

Ikkita PROTAC molekulasi ishlab chiqilgan va sintez qilingan. Tanlanganlikni solishtirish uchun maqsadli va maqsadli oqsillarni tahlil qilish kerak.

Eksperimental usul

Proteomik tahlil uchun TMT asosidagi miqdoriy MS usuli ishlatilgan.

O'simta hujayralari qatorlarida jami 5900 ta oqsil miqdori aniqlandi va PROTAC1 va 2 molekulalar uchun ON & OFF maqsadlari aniqlandi (Orbitrap Exploris 480 massa spektrometri, TMT10plex va PD 2.5 tomonidan ma'lumotlarni tahlil qilish)