Protein-oqsil o'zaro ta'siri (PPI) hujayrali hayot faoliyatining asosi bo'lib xizmat qiladi, hujayra signalizatsiyasida, tizimli yig'ilishda va patogen va xostni tanib olish kabi asosiy hayot jarayonlarida hal qiluvchi rol o'ynaydi. Shu bilan birga, ko'plab patologik jarayonlar ham PPIdagi anormalliklardan kelib chiqadi. Shu sababli, PPIga aralashish va tartibga solish tegishli kasalliklarni davolash vositasi sifatida ulkan salohiyatni ko'rsatdi.
ChomiX oqsil-oqsil o'zaro ta'sirining murakkab va nozik tarmog'ini ochish uchun mijozlar bilan qo'lda ishlashga intilgan bir qator ilg'or texnologik platformalarni birlashtiradi. Biz sizga proteomika sohasida ulkan yutuqlarga erishishingizga yordam berish uchun har tomonlama, ko'p darajali texnik yordamni taqdim etamiz.
BioID, APEX va TurboID kabi yaqinlikni belgilash (PL) texnologiyalari tirik hujayralardagi qo'shni oqsillarni kovalent tarzda belgilash uchun biotinlangan fermentlar yoki peroksidazalardan foydalanadi. Bu biotinlangan oqsillarni, ya'ni o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillarni ajratib olish va aniqlash imkonini beradi. Ushbu usul, ayniqsa, vaqtinchalik yoki dinamik oqsil o'zaro ta'sirini, shuningdek, kam miqdorda yoki hidrofobik membrana oqsillarini o'z ichiga olgan o'zaro ta'sirlarni olish uchun juda mos keladi. Mass-spektrometriya texnologiyasidan foydalangan holda, Chomix hujayralardagi murakkab biologik jarayonlarni chuqurroq tushunishga yordam berish uchun bir qator yaqinlik yorliqlash platformalarini ishlab chiqdi.
Kimyoviy o'zaro bog'liqlik massa spektrometriyasida biz birlamchi aminlar va tiollar kabi oqsillardagi ma'lum guruhlar bilan kovalent reaktsiyaga kirishadigan reaktiv funktsional guruhlarga ega chiziqli o'zaro bog'lovchilardan foydalanamiz. Ikki reaktiv aminokislota yon zanjiri yaqin joylashganda, ular o'zaro bog'lovchi bilan kovalent bog'lanadi. Turli uzunlikdagi o'zaro bog'lovchilar va reaktiv guruhlardan foydalanib, proteaz hazm qilish bilan birgalikda biz fazoviy o'zaro ta'sirni yoki qo'shni hududlarni ifodalovchi "o'zaro bog'langan" peptidlarni olishimiz mumkin. Peptidlar ketma-ketligi ma'lumotlarini tahlil qilish uchun yuqori aniqlikdagi massa spektrometriyasi orqali ushbu texnologiya oqsilning tarkibiy ma'lumotlarini olish va oqsil-oqsil o'zaro ta'sirini aniqlash uchun muvaffaqiyatli qo'llanildi. Uning afzalliklari past namuna talablari, minimal ekologik talablar, molekulyar og'irlik cheklovlari yo'qligi, in situ o'zaro bog'lanish qobiliyati, oddiy operatsiya va boy ma'lumotlar tarkibini o'z ichiga oladi. Chomix kimyoviy o'zaro bog'lovchilarning turli kombinatsiyalaridan moslashuvchan foydalanish orqali oqsil-oqsil va antikor-antigen o'zaro ta'sir hududlarini aniq xaritalash imkonini beruvchi bir qator kimyoviy o'zaro bog'lovchi massa spektrometriya texnologiyalarini ishlab chiqdi.