Proteinlar hayot faoliyatining bevosita ishtirokchilari va ijrochilari sifatida kasalliklarni davolashda hal qiluvchi maqsadlarni ifodalaydi. Kichik molekulali dorilar (odatda molekulyar og'irligi 1000 Da dan kam bo'lgan organik birikmalar) oqsil faolligini, ko'pligini va o'zaro ta'sirini nozik modulyatsiya qilish orqali samarali terapevtik ta'sir ko'rsatadi. Keng tarqalgan kichik molekulali dorilarga tabiiy mahsulotlar va ularning hosilalari (masalan, o'simlik monomerlari), shuningdek kimyoviy sintez qilingan dorilar kiradi. Inson tanasiga kirgandan so'ng, bu dorilar hujayra ichidagi yoki tashqaridan maqsadli oqsillarni bog'lash orqali o'zlarining terapevtik ta'sirini ko'rsatadi. Shu sababli, kichik molekulali dorilarning maqsadli oqsillarga qanday bog'lanishini tushunish, ayniqsa, tirik hujayralar, qon va kasal to'qimalar kabi murakkab fiziologik muhitda dori vositalarini ishlab chiqishda juda muhimdir. Kichik molekulali dorilar va oqsillar o'rtasidagi o'zaro ta'sirni chuqur tahlil qilish nafaqat dori maqsadlarini aniq aniqlash imkonini beradi, balki dori ta'sirining molekulyar mexanizmlarini va potentsial maqsaddan tashqari ta'sirlarni ham ochib beradi. Bundan tashqari, u yangi terapevtik maqsadlarni kashf etish va shu bilan kasalliklarni davolash uchun yanada boy strategiyalarni taqdim etishni va'da qiladi.
Kichik molekulali dorilarga qo'shimcha ravishda, organizmlar ichidagi ATP, xolesterin, safro kislotalari, araxidon kislotasi va retinoik kislota kabi endogen kichik molekula metabolitlari oqsillar, shu jumladan transport oqsillari, membrana bilan o'zaro ta'sir qilish orqali ko'plab muhim signal yo'llari va oqsil faoliyatini tartibga solishda ishtirok etadi. retseptorlari, transkripsiya omillari va metabolik fermentlar. So'nggi yillarda ichak mikrobiota metabolitlari va xost hujayralari o'rtasidagi o'zaro ta'sir tadqiqot nuqtasi sifatida paydo bo'ldi. Shu sababli, hujayra muhitida, ayniqsa kasallik holatida, metabolitlar va oqsillar o'rtasidagi o'zaro ta'sir tarmoqlarini chuqur o'rganish va xaritalash hayot jarayonlarini tushunish va kasalliklarni davolash uchun muhim ahamiyatga ega.
Kimyoviy proteomika, kimyoviy biologiyaning muhim tarmog'i sifatida, hozirda oqsil funktsiyasini tadqiq qilish, kichik molekuladagi dori maqsadini aniqlash va yangi dori tuzilishini skrining qilishda keng qo'llanilmoqda. Ushbu texnologik platforma fiziologik sharoitda (masalan, tirik hujayralar, qon, to'qimalar va boshqalar) kichik molekulalar va oqsillar o'rtasidagi o'zaro ta'sir mexanizmlarini yoritishga qaratilgan proteomika bilan birlashtirilgan turli xil funktsional turli xil kimyoviy zondlardan foydalanadi. Shuni ta'kidlash kerakki, tozalangan oqsil tizimlari bilan solishtirganda, tirik hujayra tizimlaridan foydalanish kimyoviy proteomikaning asosiy xususiyati hisoblanadi. Bu murakkab proteomalar ichida kichik molekulali dorilar, endogen metabolitlar va boshqalar uchun maqsadlarning tarqalishini, hatto aminokislotalar qoldig'i joylari darajasiga qadar real tasvirlash imkonini beradi.
Chomix kichik molekula-oqsil o'zaro ta'siri uchun professional tahlil xizmatlarini taklif qiladi, bu sizga potentsial dori maqsadlarini chuqurroq o'rganish va dori molekulyar mexanizmlari va yuzaga kelishi mumkin bo'lgan nojo'ya ta'sirlarni tushunishingizni kuchaytirish imkonini beradi. Bizning mutaxassis jamoamiz kimyoviy proteomikani tadqiq qilishda katta tajribaga ega va siz uchun eng mos va ishonchli usullarni tanlaydi, texnik muammolar bilan bog'liq har qanday tashvishlarni bartaraf qiladi va tadqiqotingizni osonlikcha olg'a surishga yordam beradi.
Aksariyat kichik molekulali dorilar maqsadli oqsillar bilan kovalent bo'lmagan bog'lanish orqali o'zaro ta'sir qiladi, vodorod aloqalari, p-p stacking, hidrofobik o'zaro ta'sirlar va boshqalar orqali bog'lovchi cho'ntaklardagi aminokislota qoldiqlari bilan dinamik va qaytariladigan o'zaro ta'sirlarni hosil qiladi. Shuning uchun bog'langan oqsillarni barqaror boyitish va izolyatsiya qilish. murakkab proteomalardan kovalent bo'lmagan kichik molekula preparatlari muhim ahamiyatga ega qiyinchiliklar. Buni hal qilish uchun Chomix fotoproblar asosida kimyoviy proteomika maqsadlarini aniqlash platformasini ishlab chiqdi. Ushbu platforma tirik hujayralardagi kichik molekulalar va oqsillar o'rtasidagi dinamik bog'lanishni aniq ushlaydi va ajralish va boyitishga erishadi, shu bilan proteomik darajada kovalent bo'lmagan kichik molekulali dorilar uchun to'g'ridan-to'g'ri maqsadlarni har tomonlama aniqlaydi.
Kichik molekulali dori vositalarini ishlab chiqish jarayonida birinchi navbatda preparat va oqsil o'rtasidagi bog'lanish ma'lumotlarini aniqlash, so'ngra preparat oqsil yuzasida qaysi maxsus cho'ntak bilan bog'lanishi va qanday bog'lanishini aniqlash juda muhimdir. Ushbu ma'lumot keyinchalik dori tuzilishini optimallashtirish uchun zarurdir. Klassik strukturaviy biologiya yondashuvlaridan tashqari, Chomix yuqori aniqlikdagi massa spektrometriyasiga asoslangan ilg'or kimyoviy proteomika texnologiya platformasini ham ishlab chiqdi. Ushbu platforma oqsil va hatto hujayra darajasida kovalent bo'lmagan kichik molekulali dorilar uchun bog'lovchi peptidlarni aniqlay oladi va shu bilan dori vositalarini erta ishlab chiqishda ushbu muhim muammoni hal qilishga yordam beradi.
Kovalent preparatlar sistein, lizin, serin va boshqalar bilan bog'langan maqsadli oqsillarni cho'ntaklarini bog'lashda aminokislotalar qoldiqlari bilan barqaror kovalent bog'lanish hosil qiluvchi dorilarni nazarda tutadi. Umumiy kovalent dorilarga aspirin, osimertinib, zebularin, shuningdek, tabiiy mahsulotlar kiradi. artemisinin va artesunat. Tirik hujayralarda kovalent dorilar maqsadli oqsillarda o'ziga xos aminokislota qoldiqlarini barqaror bog'lashi va egallashi mumkin. Ushbu xususiyatdan foydalanib, Chomix universal zondga asoslangan kimyoviy proteomik platformani muvaffaqiyatli ishlab chiqdi. Ushbu platforma aminokislotalar qoldiqlari darajasiga qadar kovalent kichik molekula preparatlari uchun maqsadli joyning joylashishini miqdoriy tahlil qilish imkonini beradi. Bundan tashqari, 10 000 dan ortiq aminokislotalar qoldig'i joylari uchun bandlik ma'lumotlarini tahlil qilish orqali u turli dori konsentrasiyalarida maqsadli selektivlikni aniqlay oladi, bu esa dori vositalarini erta ishlab chiqish uchun kuchli yo'l-yo'riq beradi.
Dori vositalarining yangi turi sifatida, Proteoliz Targeting Chimeras (PROTACs) an'anaviy kichik molekula ingibitorlari yoki faollashtiruvchilaridan farq qiladi. Ular endogen ubiquitin-proteazoma tizimidan (UPS) kasallikni keltirib chiqaradigan oqsillarni, ayniqsa, "davolab bo'lmaydigan" maqsadlar deb hisoblangan oqsillarni maxsus ravishda degradatsiyalash uchun foydalanish orqali tibbiy kimyoda an'anaviy "to'ldirishga asoslangan" rivojlanish kontseptsiyasini buzadi. Shuning uchun oqsillarni parchalovchi dori maqsadlarini miqdoriy aniqlash va ularning butun proteom darajasida selektivligi bunday dorilarni erta ishlab chiqish uchun juda muhimdir. Chomix turli xil miqdoriy kimyoviy proteomik texnologiya platformalarini muvaffaqiyatli ishlab chiqdi, bu maqsadli selektivlikni har tomonlama va chuqur tahlil qilishni ta'minlovchi 5000 dan ortiq oqsillarni individual hujayra liniyalarida sifat va miqdoriy tahlil qilishga qodir.