-
Kovalent bo'lmagan kichik molekula preparatlari uchun protein maqsadlarini kemoproteomik profillash
Kovalent bo'lmagan o'zaro ta'sirlar, masalan, vodorod aloqalari va p-p stacking, oqsil denaturatsiyasi tufayli buzilishi mumkin. Ushbu muammoni hal qilish uchun ChomiX platformasi oqsilning faol joyiga "kimyoviy teglar" ni aniq yopishtirish uchun yaxshi o'rnatilgan usul bo'lgan fotoaffinity yorlig'idan foydalanadi. Bundan tashqari, ChomiX ning in situ kimyoviy oʻzaro bogʻlanish strategiyasi vaqtinchalik kovalent boʻlmagan oqsil oʻzaro taʼsirini kovalent va doimiy kimyoviy bogʻlanishlarga aylantiradi. Fotoaffinlik va bioortogonal qismlar bilan ishlaydigan kimyoviy zonddan foydalangan holda, ChomiX ning kimyoproteomik platformasi hujayra lizatlari, to'qimalari va tirik hujayralardagi oqsil maqsadlarini muvaffaqiyatli aniqlashda o'zining samaradorligini ko'rsatdi. Platformada qo'llaniladigan bioaktiv kichik molekulali dorilar spektri endogen metabolitlar, tabiiy mahsulotlar va kovalent bo'lmagan sintetik molekulalarni o'z ichiga olgan turli xil birikmalarni o'z ichiga oladi.
-
Kovalent kichik molekulali dorilar uchun protein maqsadlarini raqobatbardosh kemoproteomik profillash
Kovalent bo'lmagan dorilarga o'xshab, muxbir guruhlari bilan ishlaydigan kimyoviy zondlardan foydalangan holda to'g'ridan-to'g'ri tushirish strategiyasi kovalent kichik molekulali dorilar uchun ham muvaffaqiyatli namoyish etilgan. Ammo shuni ta'kidlash joizki, ba'zi kovalent dorilar bioaktivlikni yo'qotish yoki sintetik foydalanish mumkin emasligi sababli kimyoviy modifikatsiyalarga toqat qilmaydi. Bundan tashqari, hosil bo'lgan kovalent aloqa odatda MSni aniqlashda beqaror.
Raqobatbardosh kemoproteomik strategiya ideal alternativ bo'lib, u oqsillarni etiketlash uchun universal faoliyatga asoslangan zonddan foydalanadi. Sistein, lizin, serin va histidin qoldiqlari bilan reaksiyaga kirishish uchun maxsus kimyoviy problar ishlab chiqilgan. Aslida, kovalent kichik molekula tomonidan ishg'ol qilinganidan so'ng, aminokislota qoldig'i prob tomonidan belgilanishi mumkin emas. Natijada, ON va OFF-maqsadlari aminokislotalarning o'lchamlari bilan ushbu raqobat strategiyasi bilan har tomonlama aniqlanishi mumkin edi.
-
To'g'ri kelmaydigan maqsadlar uchun yangi qo'rg'oshin tuzilmalarining kemoproteomik kashfiyoti
To'g'ri kelmaydigan maqsadlar uchun yangi qo'rg'oshin tuzilmalarining kemoproteomik kashfiyoti Texnik ma'lumot Hozirgi vaqtda FDA tomonidan tasdiqlangan dorilar tomonidan faqat ~ 800 ta protein nishonga olingan va kasallik bilan bog'liq bo'lgan ko'plab maqsadlar "davolab bo'lmaydi". Chunki, hozirgi vaqtda ko'pgina texnologiyalar tozalangan oqsillarga tayanadi. Ximproteomikaning paydo bo'lishi tozalangan oqsillardan tirik hujayralargacha bo'lgan dori-darmonlarni kashf qilishda inqilob qildi. U kichik molekulalar va... o'rtasidagi o'zaro ta'sirlarni miqdoriy tahlil qilishga qodir.
