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半胱胺酸翻譯後修飾組學分析

半胱氨酸具有顯著的反應活性,在蛋白質結構和功能中發揮關鍵作用。它作為親核試劑、氧化還原催化中心、金屬離子配體​​和構象變化的關鍵位點,廣泛參與並深刻影響蛋白質活性和調控機制。值得注意的是,半胱氨酸殘基容易發生各種類型的翻譯後修飾(PTM),不僅可以微調蛋白質的功能特性,還可能導致功能損傷。鑑於此類修飾與許多主要人類疾病密切相關,蛋白質中半胱氨酸 PTM 的定性和定量分析至關重要。這對於深入了解相關蛋白質的生物學功能及其在健康和疾病狀態下的作用機制具有不可或缺的價值。

Chomix在半胱氨酸修飾的鑑定方面擁有豐富的經驗,例如半胱氨酸過硫化。我們創新地利用基於-SH和-SSH之間pKa差異的通用半胱氨酸探針,調整pH以減少-SH的背景幹擾,使探針主要標記-SSH,從而有效識別磺化位點。

Chomix擁有先進的質譜技術,能夠直接且精確地解析各類蛋白質翻譯後修飾及其特定位點。透過分離富集技術與同位素標記等先進方法的巧妙結合,我們能夠對各種修飾進行大規模、高通量的定性和定量分析,為蛋白質翻譯後修飾的深入研究提供強有力的技術支撐。

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我們的優勢

1. 專業知識:憑藉豐富的經驗和在領先期刊上發表的論文,我們提供量身定制的服務以獲得最佳結果。

2. 嚴格的品質管理:我們成熟的品質系統遵循ISO9001標準,確保報告可靠。

3. 全方位服務:從探針設計到生物資訊分析,我們提供一站式諮詢到交付,並及時更新進度。

4. 先進設備:配備 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 和 Bruker timsTOF 等尖端質譜儀,支援突破性研究。

我們的服務

專案 半胱胺酸翻譯後修飾組學分析
樣本 純蛋白質、細胞裂解物、活細胞、病灶組織、血液、細菌、植物組織
硬體平台 非接觸式超音波細胞粉碎機,ChemiDoc MP 影像系統,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 質譜儀
專案持續時間 4-8週
可交付成果 專案報告(包括實驗流程、數據分析圖表、生物資訊分析結果)
價格 點擊諮詢

案例研究

硫醇化是指由硫化氫 (H2S) 介導的硫醇基 (-SSH) 與蛋白質中的半胱氨酸殘基的偶聯。為了進一步研究這個過程,可以從細胞或組織樣本中提取整個蛋白質組,並使用化學探針方法(半胱氨酸特異性探針)進行標記。與硫醇幹擾不同,此方法可以透過精確調節 pH 值來有效標記硫醇基團。隨後,借助高解析度質譜,研究人員可以準確地識別硫醇化位點,從而進一步闡明這種翻譯後修飾在體內的重要作用。

使用 HeLa 細胞模型,首先萃取整個蛋白質組。隨後,透過 NaHS 建模和 pH 調節,可以透過通用半胱氨酸探針準確標記硫醇基團。透過富集、酵素消化和質譜檢測等一系列步驟,鑑定出 180 個含有 -SSH 修飾的勝肽以及 120 個相關蛋白,包括報告的硫醇化位點 GAPDH_C152 和 C247。

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以下是經過 -SSH 修飾的勝肽的 MS/MS 譜圖:

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