我們的科學平台,ChomiX 螢幕,基於 DIA-ABPP(數據獨立採集-基於活性的蛋白質分析),是我們 ABPP 領先方法的重要組成部分。透過我們的ChomiX 螢幕技術平台,我們可以篩選共價先導化合物以獲得不可成藥的標靶。具體過程包括活細胞的共價分子處理、化學探針標記勝肽的分離和富集、高分辨率質譜檢測以及藥物標靶位點結合網絡的建構。這使得我們能夠同時評估藥物對多個蛋白質標靶上特定胺基酸殘基口袋的結合能力和選擇性,產生候選化合物。胺酸的共價化合物庫,基於我們的化學探針庫和其他特色核心模組。
使用定量探針標記勝肽的質譜強度來確定每種化合物的結合位點(Protein_Cys 位點)的佔用率。本質上,半胱氨酸特異性探針與化合物競爭結合到特定的結合袋。探針標記勝肽的訊號越低,化合物的佔據能力越強。對於感興趣的蛋白質 (POI) 的每個半胱氨酸位點,對選定的化合物進行劑量依賴性靶點接合比 (TE50) 的確定。然後透過 TE50 值的排名來確定熱門候選者。 TE50 越低,化合物佔據活細胞中 POI 半胱氨酸位點的能力越強。