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非共價小分子藥物直接標靶的鑑定
在疾病藥物研發領域，小分子藥物無疑地扮演著至關重要的角色。根據最近的統計，在 FDA 批准的藥物靶向的 854 個人類蛋白質標靶中，驚人的 84% 對應於小分子藥物。值得注意的是，其中只有 665 個標靶已透過小分子藥物成功開發（資料來源：https://www. Proteinatlas.org/ humanproteome/tissue/druggable）。小分子藥物可以透過非共價和共價機制與標靶蛋白相互作用。小分子藥物與目標蛋白之間的絕大多數相互作用以非共價方式發生，透過氫鍵、π-π堆積和疏水相互作用等機制與結合口袋中的氨基酸殘基形成動態、可逆的相互作用。因此，從複雜的蛋白質組中穩定富集和分離非共價小分子藥物結合的蛋白質是一項極具挑戰性的任務。
為了應對這項挑戰，Chomix開發了基於光探針的化學蛋白質體標靶辨識技術平台。該平台準確地捕獲活細胞內小分子與蛋白質的動態結合併實現分離和富集，在蛋白質組層面上全面鑑定非共價小分子藥物的直接標靶。
技術平台
基於光探針的化學蛋白質體標靶辨識平台涉及探針設計、合成、活性評估、標記、蛋白質富集和數據分析等關鍵步驟。非共價小分子藥物，包括合成物、草藥化合物、天然物和代謝物，可修飾成光反應探針。這些探針與細胞內的標靶結合後，形成穩定的共價相互作用，從而能夠選擇性富集和鑑定低豐度標靶蛋白。結合各種實驗設置，該方法提供了目標蛋白的全面定量、闡明機制、發現新靶點，並以更豐富的見解增強藥物開發。
我們的優勢
1.技術卓越：經驗豐富的團隊、頂尖期刊出版品、權威的產業服務。
2.核心專利技術：獨家專利和先進硬件，為早期藥物研發提供支援。
3.一站式服務：涵蓋探針設計、合成、標靶發現、生物資訊分析，及時回饋進度，讓客戶滿意。
4. 嚴格的品質管理：ISO9001認證確保報告的可信和真實。
我們的服務
| 專案 | 非共價小分子藥物直接標靶的鑑定 |
| 樣本 | 純蛋白質、細胞裂解物、活細胞、病灶組織、血液、細菌、植物組織 |
| 硬體平台 | 非接觸式超音波細胞粉碎機，ChemiDoc MP 影像系統，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 質譜儀 |
| 專案持續時間 | 4-8週 |
| 可交付成果 | 專案報告（包括實驗流程、數據分析圖表、生物資訊分析結果） |
| 價格 | 點擊諮詢 |
案例研究
在藥物篩選過程中，利用細胞活性篩選技術，發現化合物A對標靶細胞有顯著的抑製作用。為了進一步從分子層次鑑定其標靶蛋白，破解其作用機制，探索潛在的新靶點，我公司根據化合物A的結構和活性特徵，設計合成了光反應探針Probe A（結合光反應基團和生物正交基團）。結合生物資訊分析方法，我們深入研究了化合物A及其相關新標靶蛋白的作用機制。
根據標記實驗的螢光凝膠分析，探針A有效地標記了蛋白質，並且標記訊號可以與化合物A顯著競爭。探針工具。
火山圖展示了探針A 與DMSO（直接）實驗的結果，其中探針A 顯著富集了114 種蛋白質（在上圖中以紅色突出顯示）。 （競爭）中實驗中，38 個蛋白質（下圖中以紅色突出顯示）被探針A 標記，並與原始化合物A 顯著競爭。的蛋白質（n = 3，比率≥ 2，p -值≤0.05）。對與化合物A 結合的32 種具有高置信度的蛋白質進行GO 生物途徑分析，結果顯示訊號傳導途徑顯著富集，例如磷脂外流、脂肪酶活性的負調節和甾醇轉運的調節，與表型一致。
