了解蛋白質結構和相互作用對於揭示其生物學功能至關重要。由於蛋白質組的複雜性,沒有任何一種技術可以完全揭示這些方面。生物學家經常結合使用多種方法,其中交聯質譜 (XL-MS) 以其獨特的優勢脫穎而出。
XL-MS 提供氨基酸殘基之間的精確空間距離信息,並具有眾多優勢:樣品需求最少、環境要求低、無分子量限制、原位交聯、易於使用和廣泛的數據輸出。
ChomiX 的 XL-MS 技術使用各種化學交聯劑來靶向特定氨基酸殘基,精確交聯並分析蛋白質-蛋白質和抗體-抗原相互作用。
常見的化學交聯劑(如下圖)添加到蛋白質系統後可以共價交聯特定的胺基酸殘基。酵素消化後,產生交聯肽,代表蛋白質之間的相互作用區域。透過質譜鑑定和勝肽序列的精確分析,可以獲得相互作用區域的資訊。
氨基硫醇交聯劑 BS3
氨基-巰基交聯劑 EMCS
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專案 | 蛋白質-蛋白質和抗體-抗原相互作用的相互作用區域的鑑定 |
樣本 | 純蛋白、抗體-抗原複合物 |
硬體平台 | 非接觸式超音波細胞粉碎機,ChemiDoc MP 影像系統,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 質譜儀 |
專案持續時間 | 2-4週 |
可交付成果 | 專案報告(包括實驗流程、數據分析圖表、生物資訊分析結果) |
價格 | 點擊諮詢 |
在這種情況下,使用胺反應性交聯劑BS3交聯BSA血清蛋白,建構BSA血清蛋白的二聚體結構。二聚體結構的質譜分析確定了與現有文獻數據相符的交聯勝肽段,從而驗證了實驗的準確性和可靠性。
實際檢測到的交聯肽與以下文獻中呈現的交聯肽一致——使用二鄰苯二甲醛交聯劑以快速交聯質譜法表徵蛋白質解折疊。自然通訊,13(1),1468。