對蛋白質結構及其相互作用的深刻理解對於揭示其生物學功能至關重要。然而,由於蛋白質領域的複雜性和多樣性,單一的研究技術往往難以完全闡明其奧秘。因此,生物學家通常採取整合多種技術手段的策略來共同探索蛋白質的三維結構和動態相互作用行為。其中,交聯質譜(XL-MS)技術因其獨特的優勢,在該領域展現了突出的研究價值。它可以精確地提供氨基酸殘基之間的空間距離信息,具有樣品量小、對蛋白質環境要求低、無分子量限制、易於原位交聯、操作簡單、獲得大量蛋白質等優點。
經過二十多年的不斷發展和技術創新,XL-MS技術在實驗設計、數據分析等方面取得了重大進展,現已成為整合結構生物學不可或缺的核心工具。 Coalesce Bio 採用的 XL-MS 技術利用了化學交聯劑的不同組合。這些試劑與不同的胺基酸殘基(如羧基、氨基和巰基)反應,實現蛋白質-蛋白質和抗體-抗原相互作用的精確交聯,從而準確解析相互作用區域。
常見的化學交聯劑(如下圖)添加到蛋白質系統後可以共價交聯特定的胺基酸殘基。酵素消化後,產生交聯肽,代表蛋白質之間的相互作用區域。透過質譜鑑定和勝肽序列的精確分析,可以獲得相互作用區域的資訊。
氨基硫醇交聯劑 BS3
氨基-巰基交聯劑 EMCS
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專案 | 蛋白質-蛋白質和抗體-抗原相互作用的相互作用區域的鑑定 |
樣本 | 純蛋白、抗體-抗原複合物 |
硬體平台 | 非接觸式超音波細胞粉碎機,ChemiDoc MP 影像系統,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 質譜儀 |
專案持續時間 | 2-4週 |
可交付成果 | 專案報告(包括實驗流程、數據分析圖表、生物資訊分析結果) |
價格 | 點擊諮詢 |
在這種情況下,使用胺反應性交聯劑BS3交聯BSA血清蛋白,建構BSA血清蛋白的二聚體結構。二聚體結構的質譜分析確定了與現有文獻數據相符的交聯勝肽段,從而驗證了實驗的準確性和可靠性。