蛋白水解靶向嵌合體 (PROTAC) 藥物是一種雙功能分子,可與目標蛋白結合並招募泛素 E3 連接酶進行降解。因此,PROTAC和分子膠等新模式能夠無意中改變內源蛋白的豐度,這為蛋白質靶點,特別是不可成藥的蛋白質提供了新的治療方法。全面量化標靶和脫標蛋白的豐度一直是TPD藥物研發的標準實驗之一。
專案目標
設計並合成了兩種PROTAC分子。需要分析標靶和脫靶蛋白以比較選擇性。
實驗方法
基於TMT的定量MS方法用於蛋白質體分析。
對腫瘤細胞系中總共 5900 種蛋白質進行了定量,並確定了 PROTAC1 和 2 個分子的 ON 和 OFF 標靶(Orbitrap Exploris 480 質譜儀、TMT10plex 和透過 PD 2.5 進行數據分析)
•基於 TMT 或 DIA 的定量化學蛋白質體分析
•透過 PRM 或蛋白質印跡進行標靶驗證