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基於化學探針的蛋白質翻譯後修飾 (PTM) 分析

 

除了傳統的抗體富集策略外,化學、酵素和代謝標記技術已逐漸應用於蛋白質翻譯後修飾(PTM)的富集和鑑定。其基本原理涉及利用化學反應或酵素催化將特定分子探針共價連接到目標修飾或修飾殘基上,然後進行蛋白質體分析。這種化學蛋白質體學的新興方法在低豐度蛋白質修飾(例如棕櫚酰化、肉荳蔻酰化和糖基化)的研究中變得越來越重要。值得注意的是,它具有適用於活細胞的優點,從而避免了潛在的干擾,例如細胞壓力引起的氧化。


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技術服務

1. 半胱胺酸翻譯後修飾

半胱氨酸(Cys)是蛋白質中常見的含硫氨基酸,其硫醇基團在調節分子氧化還原穩態、透過多種翻譯後修飾過程影響酶促反應、蛋白質-蛋白質相互作用和蛋白質穩定性方面發揮著至關重要的作用。半胱胺酸常見的翻譯後修飾包括棕櫚醯化、亞硝基化、磺化和磺化。 Colosseum Biosciences開發了針對半胱氨酸殘基的通用探針或代謝標記策略,並建立了相應的化學蛋白質組學平台用於翻譯後修飾鑑定。該平台準確地識別目標蛋白和翻譯後修飾的修飾位點。

2. 賴氨酸翻譯後修飾

賴氨酸 (Lys) 是蛋白質組中具有最多樣化翻譯後修飾 (PTM) 的氨基酸之一。可逆賴氨酸翻譯後修飾 (Lys-PTM) 是常見的生化過程,在調節許多關鍵細胞功能中發揮著不可或缺的作用。賴氨酸的翻譯後修飾包括乙醯化、琥珀醯化、丙醯化、丁醯化、巴豆醯化、丙二醯化和乳醯化。 Colosseum Biosciences開發了基於賴氨酸翻譯後修飾化學探針的化學蛋白質組學技術平台,可準確識別目標蛋白和修飾位點。

3. 絲胺酸/蘇胺酸翻譯後修飾

絲胺酸(Ser)和蘇胺酸(Thr)常見的翻譯後修飾主要包括磷酸化、O-糖基化等。 這些修飾顯著影響蛋白質的活性狀態及其與其他分子的相互作用,在各種關鍵生物過程中扮演重要角色。因此,此類翻譯後修飾的分析是蛋白質功能研究的重要課題。 Colosseum Biosciences 利用磷酸化富集材料、非天然聚醣化學探針和其他工具來準確識別此類翻譯後修飾的目標蛋白和修飾位點。

我們的優勢

01.高度專業:由我公司首席科學家、北京大學王楚教授課題組提供技術支援。

02. 一站式平台:涵蓋從探針設計、探針合成、標靶發現到生物資訊分析的整個工作流程。

03. 無需抗體:特定的化學探針修飾,生理

04.環境:適用於裂解物和活細胞。

05.豐富的經驗:累積了 10 多種不同類型 PTM 的專業知識

06.高性能平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480,Thermo Fisher Q Exactive HF-X,布魯克蒂姆斯TOF

案例研究

衣康酸化是指在翻譯後修飾過程中衣康酸與蛋白質上的特定位點共價結合的過程。這種修飾可以改變蛋白質的結構和功能,影響其在細胞內的作用。例如,衣康化可以調節酵素活性、穩定性或與其他分子的相互作用。由於衣康酸是三羧酸循環的中間體,因此這種修飾與細胞的代謝狀態密切相關。研究顯示衣康酸在某些疾病的病理學中發揮重要作用,了解這種修飾機制有助於開發新的治療策略。

將ITalk探針在活細胞層級代謝標記的細胞裂解,然後進行點擊反應、富集、酵素消化等步驟,確定衣康酸化的特定部位。

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