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共價小分子藥物標靶的佔據與選擇性的定量分析

共價藥物主要透過與目標蛋白上的特定胺基酸殘基(例如半胱氨酸、賴氨酸和絲氨酸)形成共價鍵來發揮作用。阿斯匹靈是已知最早的共價藥物分子之一。此外,許多天然產物表現出共價特性,例如具有抗發炎生物活性的冬凌草甲素。近年來,共價標靶藥物越來越受到製藥公司的關注。迄今為止,至少有六種針對激酶的共價藥物已獲得 FDA 批准,其中包括針對 BTK 激酶的依魯替尼。 

在細胞或組織中發現共價藥物標靶時,一種有效的策略是透過引入報告基團(例如生物素或生物正交基團)對活性小分子進行化學修飾。這種修飾在保持分子原始活性的同時,允許直接捕獲活細胞或組織中相互作用的蛋白質標靶。然而,許多活性分子難以進行化學修飾,或與胺基酸殘基反應後形成的產物不穩定,使其不適合質譜檢測。為了克服這些挑戰,ChomiX 提供了一種解決方案:使用胺基酸特異性探針的競爭性標記來識別修飾位點。

技術平台

我們的技術平台以通用胺基酸特異性化學探針為中心。當活性小分子與胺基酸殘基反應並佔據結合位點時,與空白對照樣品相比,這種通用化學探針會對此結合位點產生顯著的訊號差異。透過檢測標記訊號中的這些差異,我們可以準確地獲得有關活性分子的目標蛋白和氨基酸殘基的信息,包括預期的(在目標)和潛在的脫靶蛋白。該技術平台為共價藥物的標靶發現和藥物作用機制的研究提供了強有力的支持。

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我們的優勢

1.技術卓越:經驗豐富的團隊、頂尖期刊出版品、權威的產業服務。
2.核心專利技術:專屬專利和先進硬件,為早期藥物研發提供支援。
3.一站式服務:涵蓋探針設計、合成、標靶發現、生物資訊分析,及時回饋進度,讓客戶滿意。
4. 嚴格的品質管理:ISO9001認證確保報告的可信和真實。

我們的服務

專案 共價小分子藥物標靶的佔據與選擇性的定量分析
樣本 純蛋白質、細胞裂解物、活細胞、病灶組織、血液、細菌、植物組織
硬體平台 非接觸式超音波細胞粉碎機,ChemiDoc MP 影像系統,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 質譜儀
專案持續時間 2-4週
可交付成果 專案報告(包括實驗流程、數據分析圖表、生物資訊分析結果)
價格 點擊諮詢

案例研究

AMG510是安進公司研發的全球首個針對KRAS-G12C突變腫瘤的標靶藥物。該計畫旨在驗證其在相應突變細胞中的目標特異性和選擇性。利用Chomix的DIA-ABPP平台,我們全面篩選了細胞中AMG510的共價標,直到胺基酸殘基水平。
實驗數據顯示,在NCI-H358細胞上進行的四次重複實驗中,系統分析了來自5,768個蛋白質的總共16,992個半胱氨酸殘基。在1μM AMG510處理下,KRAS_C12位點出現顯著變化,而KRAS_C80不受影響,這為AMG510對KRAS-G12C突變位點(標有星號表示目標半胱氨酸殘基位點)的高特異性提供了有力的證據。

 

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