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半胱氨酸翻译后修饰组学分析

半胱氨酸具有显着的反应活性,在蛋白质结构和功能中发挥着关键作用。它作为亲核试剂、氧化还原催化中心、金属离子配体和构象变化的关键位点,广泛参与并深刻影响蛋白质活性和调控机制。值得注意的是,半胱氨酸残基容易发生各种类型的翻译后修饰(PTM),这不仅可以微调蛋白质的功能特性,还可能导致功能损伤。鉴于此类修饰与许多主要人类疾病密切相关,蛋白质中半胱氨酸 PTM 的定性和定量分析至关重要。这对于深入了解相关蛋白质的生物学功能及其在健康和疾病状态下的作用机制具有不可或缺的价值。

Chomix在半胱氨酸修饰的鉴定方面拥有丰富的经验,例如半胱氨酸过硫化。我们创新地利用基于-SH和-SSH之间pKa差异的通用半胱氨酸探针,调整pH以减少-SH的背景干扰,使探针主要标记-SSH,从而有效识别磺化位点。

Chomix拥有先进的质谱技术,能够直接、准确地解析各类蛋白质翻译后修饰及其特定位点。通过分离富集技术与同位素标记等先进方法的巧妙结合,我们能够对各种修饰进行大规模、高通量的定性和定量分析,为蛋白质翻译后修饰的深入研究提供强有力的技术支撑。

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我们的优势

1. 专业知识:凭借丰富的经验和在领先期刊上发表的论文,我们提供量身定制的服务以获得最佳结果。

2. 严格的质量管理:我们成熟的质量体系遵循ISO9001标准,确保报告可靠。

3. 全方位服务:从探针设计到生物信息分析,我们提供一站式咨询到交付,并及时更新进度。

4. 先进设备:配备 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 和 Bruker timsTOF 等尖端质谱仪,支持突破性研究。

我们的服务

项目 半胱氨酸翻译后修饰组学分析
样本 纯蛋白质、细胞裂解物、活细胞、病变组织、血液、细菌、植物组织
硬件平台 非接触式超声波细胞粉碎机,ChemiDoc MP 成像系统,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 质谱仪
项目持续时间 4-8周
可交付成果 项目报告(包括实验流程、数据分析图表、生物信息学分析结果)
价格 点击咨询

案例研究

硫醇化是指由硫化氢 (H2S) 介导的硫醇基 (-SSH) 与蛋白质中的半胱氨酸残基的偶联。为了进一步研究这个过程,可以从细胞或组织样品中提取整个蛋白质组,并使用化学探针方法(半胱氨酸特异性探针)进行标记。与硫醇干扰不同,该方法可以通过精确调节 pH 值来有效标记硫醇基团。随后,借助高分辨率质谱,研究人员可以准确识别硫醇化位点,从而进一步阐明这种翻译后修饰在体内的重要作用。

使用 HeLa 细胞模型,首先提取整个蛋白质组。随后,通过 NaHS 建模和 pH 调节,可以通过通用半胱氨酸探针准确标记硫醇基团。通过富集、酶消化和质谱检测等一系列步骤,鉴定出 180 个含有 -SSH 修饰的肽以及 120 个相关蛋白,包括报道的硫醇化位点 GAPDH_C152 和 C247。

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以下是经过 -SSH 修饰的肽的 MS/MS 谱图:

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