我们的科学平台,ChomiX 屏幕,基于 DIA-ABPP(数据独立采集-基于活性的蛋白质分析),是我们 ABPP 领先方法的重要组成部分。通过我们的ChomiX 屏幕技术平台,我们可以筛选共价先导化合物以获得不可成药的靶点。具体过程包括活细胞的共价分子处理、化学探针标记肽的分离和富集、高分辨率质谱检测以及药物靶位点结合网络的构建。这使得我们能够同时评估药物对多个蛋白质靶点上特定氨基酸残基口袋的结合能力和选择性,产生候选化合物。目前,我们已经建立了全面的蛋白质靶点库,包括国内最大的针对半胱氨酸的共价化合物库,基于我们的化学探针库和其他特色核心模块。
使用定量探针标记肽的质谱强度确定每种化合物的结合位点(Protein_Cys 位点)的占用率。本质上,半胱氨酸特异性探针与化合物竞争结合到特定的结合袋。探针标记肽的信号越低,化合物的占据能力越强。对于感兴趣的蛋白质 (POI) 的每个半胱氨酸位点,对选定的化合物进行剂量依赖性靶点接合比 (TE50) 的确定。然后通过 TE50 值的排名来确定热门候选者。 TE50 越低,化合物占据活细胞中 POI 半胱氨酸位点的能力越强。