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蛋白质降解剂靶标的鉴定和选择性分析
近年来，靶向蛋白质降解（TPD）已成为一种创新的治疗策略，旨在通过使用药物分子干预蛋白质表达来调节疾病。在这些方法中，靶向嵌合体的蛋白水解（PROTAC）引起了人们的广泛关注。 PROTAC的概念最早由Crews等人提出。 2001年，其核心思想是利用内源性泛素-蛋白酶体系统降解靶蛋白，从而达到治疗目标。由于其高活性、能够靶向“不可成药”的蛋白质以及克服耐药性，PROTAC已成为药物开发的热点，辉瑞、拜耳、默克等各大制药公司积极参与该领域的研发。
除了 PROTAC 之外，还有几种类似的策略，包括利用泛素-蛋白酶体系统的分子胶降解剂、利用内体-溶酶体途径的溶酶体靶向嵌合体 (LYTAC)，以及自噬靶向嵌合体 (AUTAC) 和自噬体束缚化合物 (ATTEC) ）利用自噬-溶酶体途径。这些方法正在为疾病治疗的新途径铺平道路。
然而，开发此类分子的一个关键评估标准是它们是否能够特异性降解目标蛋白而不影响细胞中其他蛋白的丰度。为了实现这一目标，定量蛋白质组学技术发挥着至关重要的作用。该技术能够使用高分辨率质谱在蛋白质组水平上定量比较不同样品中相同蛋白质的丰度。目前，常用的定量蛋白质组学策略包括在肽样品制备过程中引入稳定同位素标记。在质谱检测过程中，由于同位素标记的质量不同，来自不同样品的具有相同氨基酸序列的肽表现出不同的质荷比。因此，同一肽序列共洗脱离子的比例可以定量反映同一蛋白质在不同样品中的丰度。该策略不仅提高了样品制备和质谱数据采集的效率，而且减少了样品间的实验误差，使结果更加稳定可靠。
技术平台
Chomix开发了多种定量化学蛋白质组学技术平台。其创新平台能够对单个细胞系中的 5,000 多种蛋白质进行精确的定性和定量分析，为全面的目标选择性分析提供强大的支持。以基于Tandem Mass Tag（TMT）标记的多定量蛋白质组技术平台为例，该技术首先从经过蛋白质降解剂处理的细胞样本中提取整个蛋白质组，然后通过酶消化和多定量标记步骤进行处理，然后再进行多定量标记。被混合在一起。为了提高蛋白质组的覆盖深度，通常利用液相色谱对肽样品进行预分级，然后对每个肽样品进行质谱检测，从而深入分析样品之间的蛋白质丰度差异，阐明关键的靶标信息和选择性数据。该平台为蛋白质降解剂的开发和优化提供评估和指导。
我们的优势
1.技术卓越：经验丰富的团队、顶级期刊出版物、权威的行业服务。
2.核心专利技术：独家专利和先进硬件，为早期药物研发提供支持。
3.一站式服务：涵盖探针设计、合成、靶点发现、生物信息分析，及时反馈进度，让客户满意。
4. 严格的质量管理：ISO9001认证确保报告的可信和真实。
我们的服务
| 项目 | 蛋白质降解剂靶标的鉴定和选择性分析 |
| 样本 | 细胞裂解液、活细胞 |
| 硬件平台 | 非接触式超声波细胞粉碎机，ChemiDoc MP 成像系统，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 质谱仪 |
| 项目持续时间 | 3-4周 |
| 可交付成果 | 项目报告（包括实验流程、数据分析图表、生物信息学分析结果） |
| 价格 | 点击咨询 |
案例研究
项目目的：设计并合成两种PROTAC分子。需要分析靶标和脱靶蛋白以比较选择性。
实验方法：采用基于TMT的定量MS方法进行蛋白质组分析。
项目成果：
对肿瘤细胞系中总共 5900 种蛋白质进行了定量，并确定了 PROTAC1 和 2 个分子的 ON 和 OFF 靶标（Orbitrap Exploris 480 质谱仪、TMT10plex 和通过 PD 2.5 进行数据分析）
