非共价小分子药物结合袋的鉴定

在小分子药物研发过程中，了解药物与靶蛋白的结合模式对于阐明药物作用机制、指导后续结构优化至关重要。 X 射线晶体学、冷冻电子显微镜 (cryo-EM) 和核磁共振 (NMR) 等结构生物学技术已成为确定药物结合模型的关键工具。特别是高分辨率的药物-蛋白质共晶结构极大地促进了药物结构的优化。

然而，蛋白质结构的阐明，特别是 GPCR 和离子通道等膜蛋白靶标的结构，一直是生命科学研究中的一项艰巨挑战。该过程涉及蛋白表达和纯化、药物蛋白结晶条件筛选、晶体数据收集和分析等多个步骤，不仅耗时而且成本高昂。

在细胞水平上，直接研究药物和靶蛋白之间的作用模式有助于避免纯化过程中蛋白质结构的变化以及人工缓冲系统和高药物蛋白浓度可能引起的假阳性结果。 Chomix致力于提供一站式服务，利用先进技术解决确定小分子药物与细胞靶蛋白相互作用的挑战，为客户的药物研发提供强有力的技术支持。

技术平台

Chomix 利用生物活性光反应化学探针（具有与药物分子类似的活性）提供化学蛋白质组学服务。这些探针在生理相关药物浓度下与疾病相关细胞或组织一起孵育，然后采用原位快速光交联技术，将药物分子探针和蛋白质靶标之间的非共价相互作用转化为共价相互作用。随后，通过目标蛋白富集、酶消化释放未修饰的肽段、选择性富集药物分子探针修饰的肽段等步骤，结合生物分子的高分辨率质谱，可以快速确定肽序列信息。最后，利用分子对接工具快速获得药物与靶蛋白的结合模型，为后续药物化学研究提供有力支持。

我们的优势

1.技术卓越：经验丰富的团队、顶级期刊出版物、权威的行业服务。
2.核心专利技术：独家专利和先进硬件，为早期药物研发提供支持。
3.一站式服务：涵盖探针设计、合成、靶点发现、生物信息分析，及时反馈进度，让客户满意。
4. 严格的质量管理：ISO9001认证确保报告的可信和真实。

我们的服务

项目	非共价小分子药物结合袋的鉴定
样本	纯蛋白质、细胞裂解物、活细胞、病变组织、血液、细菌、植物组织
硬件平台	非接触式超声波细胞粉碎机，ChemiDoc MP 成像系统，Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 质谱仪
项目持续时间	2-4周
可交付成果	项目报告（包括实验流程、数据分析图表、生物信息学分析结果）
价格	点击咨询

案例研究

候选药物分子B的靶标是具有多个药物结合袋的多次跨膜蛋白。尽管多次尝试使用X射线和冷冻电镜等结构生物学方法，但仍无法获得药物分子与靶蛋白之间的结合模型。
基于候选药物分子B的结构和活性，我公司设计合成了包含光反应基团和生物正交基团的光反应化学探针——探针B。利用上述化学蛋白质组学靶点发现平台，首先在与候选药物分子B活性相关的细胞系中验证靶蛋白。随后，利用基于质谱的非共价药物结合口袋识别技术，将空间相邻的肽段确定了药物结合袋，并提供了药物-蛋白质结合模型。