基于光亲和探针的化学蛋白质组靶标识别平台涉及探针设计、合成、活性评估、标记、蛋白质富集和数据分析等几个关键步骤。非共价小分子药物,例如合成化合物、草药提取物、天然产物和代谢物,可以修饰成光亲和探针。一旦这些探针与细胞内的靶标结合,它们就会形成稳定的共价相互作用,从而可以选择性富集和鉴定低丰度靶蛋白。
1.技术卓越:经验丰富的团队、顶级期刊出版物、权威的行业服务。
2、核心专利技术:独家专利和先进硬件,为早期药物研发提供支持。
3.一站式服务:涵盖探针设计、合成、靶点发现、生物信息分析,及时反馈进度,让客户满意。
4. 严格的质量管理:ISO9001认证确保报告的可信和真实。
项目 | 非共价小分子药物直接靶点的鉴定 |
样本 | 重组蛋白、细胞裂解物、活细胞、病变组织、血液、细菌、植物组织 |
硬件平台 | 非接触式超声波细胞粉碎机,ChemiDoc MP 成像系统,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 质谱仪 |
项目持续时间 | 4-8周 |
可交付成果 | 项目报告(包括实验流程、数据分析图表、生物信息学分析结果) |
在药物筛选过程中,利用细胞活性筛选技术,发现化合物A对靶细胞具有显着的抑制作用。为了进一步从分子水平鉴定其靶蛋白,破译其作用机制,探索潜在的新靶点,我公司根据化合物A的结构和活性特征,设计合成了光反应探针Probe A(结合光反应基团和生物正交基团)。利用化学蛋白质组学技术平台,我们采用荧光标记和质谱技术来鉴定与活性相关的细胞系中的目标蛋白。结合生物信息学分析方法,我们深入研究了化合物A及其相关新靶蛋白的作用机制。
根据标记实验的荧光凝胶分析,探针A有效地标记了蛋白质,并且标记信号可以与化合物A显着竞争。这表明探针A具有与化合物A相似的目标覆盖率,使其成为合适的化学探针工具。后续目标发现。
火山图展示了探针 A 与 DMSO(直接)实验的结果,其中探针 A 显着富集了 114 种蛋白质(在上图中以红色突出显示)。在探针 A 与(A+探针 A)(竞争)中实验中,38 个蛋白质(下图中以红色突出显示)被探针 A 标记,并与原始化合物 A 显着竞争。这两个实验生成了 32 个与化合物 A 结合具有高置信度的蛋白质(n = 3、比率 ≥ 2,p 值 ≤ 0.05)。对与化合物 A 结合的 32 种具有高置信度的蛋白质进行 GO 生物途径分析,结果显示信号传导途径显着富集,例如磷脂外流、脂肪酶活性的负调节和甾醇转运的调节,与表型一致。