了解蛋白质结构和相互作用对于揭示其生物学功能至关重要。由于蛋白质组的复杂性,没有任何一种技术可以完全揭示这些方面。生物学家经常结合使用多种方法,其中交联质谱 (XL-MS) 以其独特的优势脱颖而出。
XL-MS 提供氨基酸残基之间的精确空间距离信息,并具有众多优势:样品需求最少、环境要求低、无分子量限制、原位交联、易于使用和广泛的数据输出。
ChomiX 的 XL-MS 技术使用各种化学交联剂来靶向特定氨基酸残基,精确交联并分析蛋白质-蛋白质和抗体-抗原相互作用。
常见的化学交联剂(如下图所示)添加到蛋白质系统中后可以共价交联特定的氨基酸残基。酶消化后,产生交联肽,代表蛋白质之间的相互作用区域。通过质谱鉴定和肽序列的精确分析,可以获得相互作用区域的信息。
氨基硫醇交联剂 BS3
氨基-巯基交联剂 EMCS
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5. 尖端设备:我们配备 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 和 Bruker timsTOF 等先进质谱仪,促进突破性研究。
项目 | 蛋白质-蛋白质和抗体-抗原相互作用的相互作用区域的鉴定 |
样本 | 纯蛋白、抗体-抗原复合物 |
硬件平台 | 非接触式超声波细胞粉碎机,ChemiDoc MP 成像系统,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 质谱仪 |
项目持续时间 | 2-4周 |
可交付成果 | 项目报告(包括实验流程、数据分析图表、生物信息学分析结果) |
价格 | 点击咨询 |
在这种情况下,使用胺反应性交联剂BS3交联BSA血清蛋白,构建BSA血清蛋白的二聚体结构。二聚体结构的质谱分析确定了与现有文献数据相匹配的交联肽段,从而验证了实验的准确性和可靠性。
实际检测到的交联肽与以下文献中提出的交联肽一致——使用二邻苯二甲醛交联剂通过快速交联质谱法表征蛋白质解折叠。自然通讯,13(1),1468。