蛋白质相互作用(PPI)是细胞生命活动中不可或缺的核心组成部分,跨越多个时空维度,深刻影响细胞周期调控、蛋白质合成与分泌、信号转导和代谢等关键细胞过程。因此,对蛋白质相互作用的深入研究对于揭开分子调控网络的奥秘起着关键作用。
目前,研究蛋白质相互作用的常用技术包括免疫共沉淀、pull-down 测定、蛋白质微阵列等。然而,这些方法在实际应用中面临着诸多挑战,例如对抗体的过度依赖以及难以有效捕获瞬时或微弱的相互作用。邻近标记技术的出现就是为了解决这些挑战,通过酶对邻近的目标蛋白进行生物素化,然后进行 PPI 的亲和纯化和质谱表征。其中,基于抗坏血酸过氧化物酶(APEX)和生物素连接酶的邻近标记方法是最广泛用于PPI鉴定的方法。 TurboID 是一种基于邻近依赖性生物素识别 (BioID) 开发的新技术平台,采用突变形式的大肠杆菌生物素连接酶。 CoLinkBio 基于质谱的邻近标记技术平台涵盖多种技术,包括 BioID、APEX、TurboID 等。这些技术在活细胞系统中表现出出色的适用性,特别是在捕获瞬时或动态蛋白质相互作用事件以及涉及低丰度蛋白质或疏水性膜蛋白的相互作用方面。
以TurboID技术平台为例,该平台将突变的生物素连接酶融合到目标蛋白的C末端。在过度表达的细胞中,添加生物素刺激物可以在 10 分钟内快速对目标蛋白的相互作用蛋白进行生物素化。该标记过程不仅快速、背景低,而且即使在室温下也能顺利进行。因此,TurboID技术平台显着扩展了其适用性,不仅适用于哺乳动物细胞系统,还适用于植物、昆虫等多种生物系统。随后,通过分离和富集生物素标记的蛋白质,然后进行酶消化,可以轻松获得肽样品进行质谱分析,从而能够深入研究蛋白质相互作用及其功能。
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项目 | 细胞中蛋白质-蛋白质相互作用网络的鉴定 |
样本 | 细胞裂解液、活细胞 |
硬件平台 | 非接触式超声波细胞粉碎机,ChemiDoc MP 成像系统,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 质谱仪 |
项目持续时间 | 4-6周 |
可交付成果 | 项目报告(包括实验流程、数据分析图表、生物信息学分析结果) |
价格 | 点击咨询 |
项目目标:分析药物治疗前后细胞中靶蛋白(POI)的蛋白质相互作用组的变化。
解决方案:利用邻近标记策略,构建 POI-TurboID 表达载体,在细胞中过度表达,并设置药物处理组和对照组进行生物素化。富集细胞中的蛋白质相互作用组,然后对生物素化蛋白质的差异进行定性和定量分析,以表征 POI 相互作用组的变化。
数据可视化: