产品
化学蛋白质组学发现不可成药靶标的新先导结构
技术背景
目前，FDA批准的药物仅针对约800种蛋白质，并且大量与疾病相关的靶点是“不可成药的”。因为，目前大多数技术都依赖于纯化的蛋白质。化学蛋白质组学的出现彻底改变了从纯化蛋白质到活细胞的药物发现。它能够定量分析人类蛋白质组规模中小分子和蛋白质之间的相互作用。现在，针对蛋白质靶标的特定氨基酸残基（例如半胱氨酸、赖氨酸、蛋氨酸和酪氨酸）的共价结构的发现已在细胞裂解物和活细胞中得到证实。ChomiX将利用自有的化学蛋白质组学平台，快速突破“不可成药”靶点的障碍。
技术优势
平台技术特点
DIA-ABPP 平台旨在发现通过与半胱氨酸残基的硫醇基团发生共价反应来接合蛋白质靶标的共价结合剂。一旦蛋白质的活性半胱氨酸残基被共价分子优先占据，与硫醇基团特异性反应的通用探针的标记就会被竞争。结合基于DIA的定量蛋白质组学技术，可以定量共价分子和对照组之间探针标记的肽的强度。这些信号差异代表共价分子对其结合蛋白的占据率。与传统的单靶点筛选策略不同，DIA-ABPP平台能够以氨基酸残基的分辨率定量分析片段亲电子试剂与活细胞中几乎所有蛋白质之间的相互作用，这大大提高了高通量先导结构发现项目的效率并降低了风险。
共价先导化合物筛选的工作流程
特点1
我们的类药物分子库包含多种具有温和亲电反应性的反应基团（弹头），例如丙烯酰胺、氯乙酰胺和炔酰胺。这些分子具有结构多样的药效团，符合利平斯基五法则。
特点2
目前，硫醇特异性化学探针捕获的蛋白质靶标库涵盖了12421个蛋白质的39962个半胱氨酸位点，包括激酶、磷酸酶、连接酶和转录因子。该库不断更新，确保访问特定目标和地点的最新信息。有关特定目标和站点的详细信息可通过以下链接获得。
特点3
在单次筛选实验中，该平台能够量化小分子 (A2-H6) 对整个蛋白质组中所有标记蛋白质的靶标参与。上图显示了共价分子对选定的临床重要靶标的位点占用。颜色越深，分子对结合口袋的占有率越高，包括正构和变构位点（星号表示占有率高于80%）。因此，可以同时评估每个分子的亲和力和选择性，以进行后续的结构优化。