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确定小分子药物与其靶蛋白的结合模式对于药物研发至关重要。在结构和物理化学水平上对这些相互作用进行全面分析可以显着加深我们对蛋白质功能的理解并促进药物设计和优化。结构生物学技术，包括X射线、冷冻电子显微镜（cryo-EM）、核磁共振（NMR）等，已广泛应用于药物结合模式的测定。蛋白质-药物复合物的高分辨率结构可以极大地有利于药物早期结构的优化。然而，蛋白质结构分析一直给生命科学研究带来挑战，特别是对于 G 蛋白偶联受体 (GPCR) 和离子通道蛋白等膜蛋白靶标。它通常在蛋白质纯化、蛋白质-药物复合物结晶筛选以及数据采集和处理等过程中消耗大量时间和资源。

一种理想的方法是识别活细胞内的蛋白质-药物相互作用模式。这种方法不仅避免了与结构研究相关的高成本，而且还消除了高盐缓冲液或饱和药物等人为条件可能导致的误报。