蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 药物是一种双功能分子,可以与靶蛋白结合并招募泛素 E3 连接酶进行降解。因此,PROTAC和分子胶等新模式能够无意中改变内源蛋白的丰度,这为蛋白质靶点,特别是不可成药的蛋白质提供了新的治疗方法。全面量化靶标和脱靶蛋白的丰度一直是TPD药物研发的标准实验之一。
项目目标
设计并合成了两种PROTAC分子。需要分析靶标和脱靶蛋白以比较选择性。
实验方法
基于TMT的定量MS方法用于蛋白质组分析。
对肿瘤细胞系中总共 5900 种蛋白质进行了定量,并确定了 PROTAC1 和 2 个分子的 ON 和 OFF 靶标(Orbitrap Exploris 480 质谱仪、TMT10plex 和通过 PD 2.5 进行数据分析)
•基于 TMT 或 DIA 的定量化学蛋白质组分析
•通过 PRM 或蛋白质印迹进行靶标验证