过去几十年来,研究人员发现人类蛋白质组的复杂性远远超过基因组。虽然大约 20,000-25,000 个人类基因编码超过一百万个蛋白质变体,但这种现象是由基因重组、选择性转录起始、差异转录终止和剪接等机制引起的。此外,翻译后修饰(PTM)在增强蛋白质组复杂性方面发挥着至关重要的作用。 PTM 通过添加或去除特定的化学基团来显着改变蛋白质的物理和化学性质。这些变化不仅重塑蛋白质的空间构型并调节其活性状态,而且影响蛋白质定位、细胞内折叠稳定性以及蛋白质相互作用网络的构建。
随着研究的进展,翻译后修饰已成为科学界的热门话题。磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化等多种PTM因其独特的作用机制而受到广泛关注。这些修饰可以对靶蛋白的功能特性产生不同的影响,有时会产生相反的效果,从而在细胞信号传导、代谢调节和疾病发展中发挥关键作用。
除了传统的抗体富集策略外,化学/酶标记和代谢标记策略已逐渐应用于翻译后修饰的富集和鉴定。这些新兴的化学蛋白质组学分析方法涉及通过化学或酶催化反应将特定分子探针与目标修饰或修饰残基共价连接,从而实现组学分析。它们在低丰度修饰(例如棕榈酰化、肉豆蔻酰化和糖基化)的研究中表现出显着的优势。此外,这些策略可以应用于活细胞系统,避免细胞裂解相关氧化引起的潜在干扰。
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半胱氨酸(Cys)是蛋白质中常见的含硫氨基酸,其硫醇基团在调节分子氧化还原稳态、通过多种翻译后修饰过程影响酶促反应、蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质稳定性方面发挥着至关重要的作用。半胱氨酸常见的翻译后修饰包括棕榈酰化、亚硝基化、磺化和磺化。 Colosseum Biosciences开发了针对半胱氨酸残基的通用探针或代谢标记策略,并建立了相应的化学蛋白质组学平台用于翻译后修饰鉴定。该平台准确识别目标蛋白和翻译后修饰的修饰位点。
赖氨酸 (Lys) 是蛋白质组中具有最多样化翻译后修饰 (PTM) 的氨基酸之一。可逆赖氨酸翻译后修饰 (Lys-PTM) 是常见的生化过程,在调节许多关键细胞功能中发挥着不可或缺的作用。赖氨酸的翻译后修饰包括乙酰化、琥珀酰化、丙酰化、丁酰化、巴豆酰化、丙二酰化和乳酰化。 Colosseum Biosciences开发了基于赖氨酸翻译后修饰化学探针的化学蛋白质组学技术平台,可准确识别目标蛋白和修饰位点。
丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)常见的翻译后修饰主要包括磷酸化、O-糖基化等。这些修饰显着影响蛋白质的活性状态及其与其他分子的相互作用,在各种关键生物过程中发挥重要作用。因此,对此类翻译后修饰的分析是蛋白质功能研究的一个重要课题。 Colosseum Biosciences 利用磷酸化富集材料、非天然聚糖化学探针和其他工具来准确识别此类翻译后修饰的目标蛋白和修饰位点。