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基于化学探针的蛋白质翻译后修饰 (PTM) 分析

 

除了传统的抗体富集策略外,化学、酶和代谢标记技术已逐渐应用于蛋白质翻译后修饰(PTM)的富集和鉴定。其基本原理涉及利用化学反应或酶催化将特定分子探针共价连接到目标修饰或修饰残基上,然后进行蛋白质组分析。这种化学蛋白质组学的新兴方法在低丰度蛋白质修饰(例如棕榈酰化、肉豆蔻酰化和糖基化)的研究中变得越来越重要。值得注意的是,它具有适用于活细胞的优点,从而避免了潜在的干扰,例如细胞应激引起的氧化。


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技术服务

1. 半胱氨酸翻译后修饰

半胱氨酸(Cys)是蛋白质中常见的含硫氨基酸,其硫醇基团在调节分子氧化还原稳态、通过多种翻译后修饰过程影响酶促反应、蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质稳定性方面发挥着至关重要的作用。半胱氨酸常见的翻译后修饰包括棕榈酰化、亚硝基化、磺化和磺化。 Colosseum Biosciences开发了针对半胱氨酸残基的通用探针或代谢标记策略,并建立了相应的化学蛋白质组学平台用于翻译后修饰鉴定。该平台准确识别目标蛋白和翻译后修饰的修饰位点。

2. 赖氨酸翻译后修饰

赖氨酸 (Lys) 是蛋白质组中具有最多样化翻译后修饰 (PTM) 的氨基酸之一。可逆赖氨酸翻译后修饰 (Lys-PTM) 是常见的生化过程,在调节许多关键细胞功能中发挥着不可或缺的作用。赖氨酸的翻译后修饰包括乙酰化、琥珀酰化、丙酰化、丁酰化、巴豆酰化、丙二酰化和乳酰化。 Colosseum Biosciences开发了基于赖氨酸翻译后修饰化学探针的化学蛋白质组学技术平台,可准确识别目标蛋白和修饰位点。

3. 丝氨酸/苏氨酸翻译后修饰

丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)常见的翻译后修饰主要包括磷酸化、O-糖基化等。这些修饰显着影响蛋白质的活性状态及其与其他分子的相互作用,在各种关键生物过程中发挥重要作用。因此,对此类翻译后修饰的分析是蛋白质功能研究的一个重要课题。 Colosseum Biosciences 利用磷酸化富集材料、非天然聚糖化学探针和其他工具来准确识别此类翻译后修饰的目标蛋白和修饰位点。

我们的优势

01.高度专业:由我公司首席科学家、北京大学王楚教授课题组提供技术支持。

02. 一站式平台:涵盖从探针设计、探针合成、靶标发现到生物信息学分析的整个工作流程。

03. 无需抗体:特定的化学探针修饰,生理

04.环境:适用于裂解物和活细胞。

05.丰富的经验:积累了 10 多种不同类型 PTM 的专业知识

06.高性能平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480,Thermo Fisher Q Exactive HF-X,布鲁克蒂姆斯TOF

案例研究

衣康酸化是指在翻译后修饰过程中衣康酸与蛋白质上的特定位点共价结合的过程。这种修饰可以改变蛋白质的结构和功能,影响其在细胞内的作用。例如,衣康化可以调节酶活性、稳定性或与其他分子的相互作用。由于衣康酸是三羧酸循环的中间体,因此这种修饰与细胞的代谢状态密切相关。研究表明衣康酸在某些疾病的病理学中发挥着重要作用,了解这种修饰机制有助于开发新的治疗策略。

将ITalk探针在活细胞水平代谢标记的细胞裂解,然后进行点击反应、富集、酶消化等步骤,确定衣康酸化的具体位点。

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