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非共价小分子药物蛋白质靶标的化学蛋白质组学分析
非共价相互作用，例如氢键和 π-π 堆积，可能会因蛋白质变性而被破坏。为了应对这一挑战，ChomiX 平台采用光亲和标记，这是一种成熟的技术，可将“化学标记”精确地附加到蛋白质的活性位点。此外，ChomiX 的创新原位化学交联策略将瞬时非共价蛋白质相互作用转化为共价和永久化学键。通过利用光亲和和生物正交部分功能化的化学探针，ChomiX 的化学蛋白质组学平台已证明其在成功捕获细胞裂解物、组织和活细胞内蛋白质靶点方面的有效性。该平台应用的生物活性小分子药物涵盖多种化合物，包括内源代谢物、天然产物和非共价合成分子。
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共价小分子药物蛋白质靶标的竞争性化学蛋白质组学分析
与非共价药物类似，使用报告基团功能化的化学探针的直接下拉策略也已成功应用于共价小分子药物。然而，值得注意的是，一些共价药物由于生物活性丧失或合成无法获得而不能耐受化学修饰。此外，形成的共价键在MS检测过程中通常不稳定。
竞争性化学蛋白质组学策略是一种理想的替代方案，它使用基于活性的通用探针进行蛋白质标记。已开发出与半胱氨酸、赖氨酸、丝氨酸和组氨酸残基反应的特定化学探针。原则上，一旦被共价小分子占据，氨基酸残基就不能被探针标记。因此，通过这种竞争策略，可以通过氨基酸的分辨率来全面识别ON和OFF靶点。
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化学蛋白质组学发现不可成药靶标的新先导结构
化学蛋白质组学发现不可成药靶点的新先导结构技术背景目前，FDA批准的药物仅针对约800种蛋白质，并且大量与疾病相关的靶点是“不可成药”的。因为，目前大多数技术都依赖于纯化的蛋白质。化学蛋白质组学的出现彻底改变了从纯化蛋白质到活细胞的药物发现。它能够定量分析小分子和...之间的相互作用。
